<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE>Message</TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1607" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><SPAN class=753362310-17042008><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>Hi 
All</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=753362310-17042008><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>I 
think, if I'm following this debate correctly that there are two ways of 
identifying high-frequency (gamma) activity; that which is time-locked or evoked 
and can be either carried out on all trials then averaged, or averaged and then 
T-F transformed; and that which "jitters" with each trial, and is defined as 
<STRONG>INDUCED </STRONG>(Tallon-Baudry & Bertrand 1999), where the ERP 
is subtracted from each trial and then each trial is T-F transformed, with 
a grand average of spectral component of interest being created from the 
output.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=753362310-17042008><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2></FONT></SPAN> </DIV>
<DIV><SPAN class=753362310-17042008><FONT face=Arial color=#0000ff size=2>Hope 
that helps</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=753362310-17042008><FONT face=Arial color=#0000ff 
size=2>Caroline Brown</FONT></SPAN></DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV align=left><FONT face=Arial size=2>
<DIV align=left><SPAN class=349154416-21122004><FONT face=Arial 
size=2>*-*-*-*-<SPAN class=349154416-21122004><FONT face=Arial 
size=2>*-*-*-*-<SPAN class=349154416-21122004><FONT face=Arial 
size=2>*-*-*-*-<SPAN class=349154416-21122004><FONT face=Arial 
size=2>*-*-*-*-<SPAN class=349154416-21122004><FONT face=Arial 
size=2>*-*-*-*-</FONT></SPAN></FONT></SPAN></FONT></SPAN></FONT></SPAN></FONT></SPAN></DIV>
<DIV align=left><SPAN class=349154416-21122004><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=349154416-21122004><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=349154416-21122004><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=349154416-21122004><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=349154416-21122004>Dr Caroline C 
Brown</SPAN></FONT></SPAN></FONT></SPAN></FONT></SPAN></FONT></SPAN></DIV>
<DIV align=left><FONT face=Arial size=2>Lecturer in Biological 
Psychology</FONT></DIV>
<DIV align=left><FONT face=Arial size=2>School of Psychology, University of West 
of England, Bristol</FONT></DIV>
<DIV align=left><FONT face=Arial size=2></FONT> </DIV>
<DIV align=left><A href="mailto:carolinec.brown@uwe.ac.uk"><FONT face=Arial 
size=2>carolinec.brown@uwe.ac.uk</FONT></A><FONT face=Arial size=2> 
</FONT></DIV>
<DIV align=left><FONT face=Arial size=2>Tel: +44 (0) 117 328 
3616</FONT></DIV></FONT></DIV>
<BLOCKQUOTE dir=ltr style="MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV></DIV>
  <DIV class=OutlookMessageHeader lang=en-us dir=ltr align=left><FONT 
  face=Tahoma size=2>-----Original Message-----<BR><B>From:</B> 
  eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu [mailto:eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu] 
  <B>On Behalf Of </B>Stanley Klein<BR><B>Sent:</B> 15 April 2008 
  21:41<BR><B>To:</B> eeglablist@sccn.ucsd.edu<BR><B>Subject:</B> Re: 
  [Eeglablist] Time-frequency analysis (subtraction first oranalysis 
  first)<BR><BR></FONT></DIV>It looks like there is some consensus on whether to 
  subtract first and then the TF or vice versa. That's nice. [On the other hand 
  subtracting first is a nice way to get rid of ERP, but there are better ways, 
  as described next.]<BR><BR>Andrei, I'm not sure I understood your last comment 
  or question, but I have a related question. Whenever one does time-frequency 
  power plots I would think that one should ALWAYS first get the time locked 
  average and subtract it off  of all the individual trials. Then one could 
  do a TF plot of each. How many on this list do that?  I suspect that 
  people mix together the standard evoked response and also the phase varying 
  response. Why do that since its so easy to show the the two TF plots 
  separately.<BR><BR>Also I've heard rumors that saccades and microsaccades are 
  responsible for most EEG gamma oscillations. So one should also put those 
  events into a separate category too. Too bad things are complicated. But it 
  makes life interesting. <BR>Stan<BR><BR>
  <DIV class=gmail_quote>On Tue, Apr 15, 2008 at 9:38 AM, Andrei Medvedev <<A 
  href="mailto:am236@georgetown.edu">am236@georgetown.edu</A>> wrote:<BR>
  <BLOCKQUOTE class=gmail_quote 
  style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid">Hi 
    All,<BR><BR>I think this was just a small mistake confusing options 1 and 2. 
    I believe so because it is option 1 (not 2) which would require pairing of 
    trials to do EEG subtraction first, which is indeed a rare 
    possibility.<BR><BR>To me, it also looks like option 2 is more correct 
    because TF analysis (in its most common 'spectral perturbation' or 'induced 
    activity' version) looks for changes in spectra regardless of phase. This is 
    why if you analyze only one condition, you do TF first and then average 
    trials. Similar thing should then be done when comparing two conditions, 
    that is, TF first.<BR><BR>With one condition, you can also do averaging 
    first and then TF, in this case you would have the so-called 'evoked' 
    responses in the frequency domain (instead of 'induced' responses mentioned 
    above). Evoked activity shows you the frequency components phase-locked to 
    the stimulus (a more strict form of time locking). If you try to do similar 
    thing with two conditions (trials should be paired somehow but there is no 
    'natural' way to pair them, only in some special circumstances), you will 
    have a problem of phase relations between conditions and may get different 
    answers (such as sum/subtraction of in-phase/out-of-phase sine waves, as 
    other people point out). This would be a very different response and I 
    believe nobody is doing this. But theoretically, this type of response can 
    be explored as well (if you have a 'natural' way of pairing 
    trials).<BR><BR>BTW, I haven't tried to use TF decomposition in EEGLAB 
    applied to the averaged ERP (i.e., averaging of trials first, then TF 
    resulting in an 'evoked' response for one condition). Has anyone tried 
    this?<BR><BR>Regards,<BR>Andrei.<BR><BR>Georgetown University<BR>
    <DIV>
    <DIV></DIV>
    <DIV class=Wj3C7c><BR><BR>----- Original Message -----<BR>From: Arnaud 
    Delorme <<A 
    href="mailto:arno@cerco.ups-tlse.fr">arno@cerco.ups-tlse.fr</A>><BR>Date: 
    Sunday, April 13, 2008 1:53 pm<BR>Subject: Re: [Eeglablist] Time-frequency 
    analysis (subtraction first or analysis first)<BR><BR>> Dear 
    Hsu,<BR>><BR>> only your first statement is correct. The second one 
    could be<BR>> correct if<BR>> you could pair the trials, but it would 
    be very rare that you would<BR>> want<BR>> to do this (since trials 
    are recorded at different times and are<BR>> usually<BR>> not paired 
    between conditions). Look up the help of the newtimef<BR>> function which 
    allows computing differences between power between<BR>> different 
    conditions and newcrossf which allows computing<BR>> difference<BR>> 
    between phase coherence images.<BR>><BR>> Best,<BR>><BR>> 
    Arno<BR>><BR>> Hsu, Shen-Mou wrote:<BR>> > Dear 
    list-memebers,<BR>> ><BR>> > Suppose that I am interested in 
    comparing two conditions A and B<BR>> in terms of their power and phase 
    coherence. I was wondering which<BR>> one of the following steps is more 
    theoretically correct. 1. After<BR>> segmentation, calculate the EEG 
    differences between the condition A<BR>> and B and then perform 
    time-frequency analysis on the differences.<BR>> 2. After segmentation, 
    perform time-frequency analysis on the EEG<BR>> data of the condition A 
    and B respectively and then compute the<BR>> power or phase coherence 
    differences between two conditions. Any<BR>> comments would be much 
    appreciated.<BR>> ><BR>> > Many thanks,<BR>> ><BR>> 
    > Shen-Mou Hsu<BR>> ><BR>> 
    _______________________________________________<BR>> Eeglablist page: <A 
    href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" 
    target=_blank>http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</A><BR>> To 
    unsubscribe, send an empty email to eeglablist-<BR></DIV></DIV>> 
    unsubscribe@sccn.ucsd.eduFor digest mode, send an email with the<BR>
    <DIV class=Ih2E3d>> subject "set digest mime" to <A 
    href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</A><BR>><BR><BR></DIV>
    <DIV>
    <DIV></DIV>
    <DIV 
    class=Wj3C7c>_______________________________________________<BR>Eeglablist 
    page: <A href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" 
    target=_blank>http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</A><BR>To 
    unsubscribe, send an empty email to <A 
    href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</A><BR>For 
    digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <A 
    href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</A><BR></DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR>
  <DIV>
  <P>
  <HR>
  This incoming email to UWE has been independently scanned for viruses by 
  McAfee anti-virus software and none were detected 
  <P></P></DIV></BLOCKQUOTE>
<DIV><P><HR>
This email was independently scanned for viruses by McAfee anti-virus software and none were found
</P></DIV>
</BODY></HTML>