Keith - <br><br>We typically highpass filter the data before applying ICA decomposition to better focus on the oscillatory regime and above. The data filtered out (e.g. < 1 Hz) could also be decomposed by ICA -- and the results might well be different. I fear that the lowpass data could contain slow sweeping potentials for which ICA is not ideal (though perhaps still useful). ICA must decompose a spatially-moving phenomenon into a series of components activated in overlapping succession, like overlapping 'movie frames.'  How is the CNV in fact accounted by ICA? e.g. What does an envtopo()  (Plot > Component ERPs > With Component Maps) look like?<br>
<br>It would be of interest to hear more about what your results might be in these directions.<br><br>Scott Makeig<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 8, 2009 at 10:01 AM, Keith Yoder <span dir="ltr"><<a href="mailto:kjyoder@gmail.com">kjyoder@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div>Hi all,<br></div><div></div><div>Our group has EEG time-series data collected with a BioSemi ActiveTwo 128-electrode cap.  Our paradigm includes a Go-NoGo, with an alerting stimulus (S1) preceding the presentation of the Go-NoGo stimulus (S2).  S1 and S2 are separated by 3 seconds.  When we examine ERPs from single electrodes, we observe a typical contingent negative variation (CNV).  However, when we run ICA (runica), none of the components isolate the CNV.  We've tried highpass filtering at 0.5hz (obviously to high), 0.01hz and without any highpass filtering, all without success.  Has anyone else run into a similar problem?  Does anyone have any additional advice for isolating a CNV with ICA?</div>

<div></div><div>Thanks,</div><div>Keith Yoder</div><div>--</div><font color="#888888"><div>Research Assistant</div><div>Belmonte Autism Lab</div><div>Cornell University</div>
</font><br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Scott Makeig, Research Scientist and Director, Swartz Center for Computational Neuroscience, Institute for Neural Computation, University of California San Diego, La Jolla CA 92093-0961, <a href="http://sccn.ucsd.edu/~scott">http://sccn.ucsd.edu/~scott</a><br>