Thank you, everyone!  These are incredibly helpful tips.<br><br>
<div class="gmail_quote">On Fri, Nov 27, 2009 at 11:44 AM, Indir Jaganjac <span dir="ltr"><<a href="mailto:ijaganjac@yahoo.com">ijaganjac@yahoo.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class="gmail_quote">
<table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
<tbody>
<tr>
<td valign="top">
<div>Hi Zach,</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>Mr.Bradley Voytek and Dr.Aranud Delorme have made excellent comments.</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>My experience is:</div>
<div> </div>
<div>Inter-Trial Coherence (ITC) or phase-locking factor is important for detection of<br>transient event-related spectral perturbation (ERSP). </div>
<div>ERSP/ITC frequency range is usually in 3-25 Hz.</div>
<div> </div>
<div>You can extract phase angle P and magnitude M, from Inter-Trial Coherence (ITC) matrix in this way:</div>
<div>P = angle(ITC), where P is phase angle matrix in radians, for each element in ITC matrix (in interval -pi,+ pi).<br>M = abs(ITC), where M is magnitude.</div>
<div> </div>
<div>You can also try function phasecoher for estimating inter-trial amp/coherence using Gaussian wavelets:</div>
<div>[amps,cohers ] = phasecoher(data,frames,srate,freq,cycles);<br>amps = mean amplitude at each time point<br>cohers = phase coherence at each time point [0,1]</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>  </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>regards,</div>
<div>I. Jaganjac</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>From: Zachary Moran <<a href="mailto:zdmoran@gmail.com" target="_blank">zdmoran@gmail.com</a>><br>Precedence: list<br>MIME-Version: 1.0 
<div class="im"><br>To: <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a><br></div>Date: Tue, 24 Nov 2009 15:28:00 -0800<br>Message-ID: <<a href="mailto:93a92c840911241528v33775b77q8319fffc9354f77b@mail.gmail.com" target="_blank">93a92c840911241528v33775b77q8319fffc9354f77b@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: <span>multipart</span>/alternative; boundary=001636b148eafdf2820479264a7c<br>Subject: [Eeglablist] Extracting Phase Angle from ITC Matrix<br>Message: 1</div>
<div>--001636b148eafdf2820479264a7c<br>Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1</div>
<div>Hey everyone,</div>
<div class="im">
<div>I'm wondering whether anyone knows how to extract an estimate of phase angle<br>(or average phase angle) from the newtimef ITC output matrix.  When I look<br>at the matrix, I can see that the estimates in each cell are provided in<br>
complex number form - does part of this number pertain to phase angle for<br>that frequency and time point?  Any help or information would be greatly<br>appreciated!</div></div>
<div>Many thanks,<br>Zach</div>
<div><br> </div></td></tr></tbody></table><br></blockquote></div><br>