<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><DIV>Hi Zach,</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Mr.Bradley Voytek and Dr.Aranud Delorme have made excellent comments.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>My experience is:</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Inter-Trial Coherence (ITC) or phase-locking factor is important for detection of<BR>transient event-related spectral perturbation (ERSP). </DIV>
<DIV>ERSP/ITC frequency range is usually in 3-25 Hz.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>You can extract phase angle P and magnitude M, from Inter-Trial Coherence (ITC) matrix in this way:</DIV>
<DIV>P = angle(ITC), where P is phase angle matrix in radians, for each element in ITC matrix (in interval -pi,+ pi).<BR>M = abs(ITC), where M is magnitude.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>You can also try function phasecoher for estimating inter-trial amp/coherence using Gaussian wavelets:</DIV>
<DIV>[amps,cohers ] = phasecoher(data,frames,srate,freq,cycles);<BR>amps = mean amplitude at each time point<BR>cohers = phase coherence at each time point [0,1]</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>  </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>regards,</DIV>
<DIV>I. Jaganjac</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>From: Zachary Moran <<A href="mailto:zdmoran@gmail.com">zdmoran@gmail.com</A>><BR>Precedence: list<BR>MIME-Version: 1.0<BR>To: <A href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu">eeglablist@sccn.ucsd.edu</A><BR>Date: Tue, 24 Nov 2009 15:28:00 -0800<BR>Message-ID: <<A href="mailto:93a92c840911241528v33775b77q8319fffc9354f77b@mail.gmail.com">93a92c840911241528v33775b77q8319fffc9354f77b@mail.gmail.com</A>><BR>Content-Type: <SPAN>multipart</SPAN>/alternative; boundary=001636b148eafdf2820479264a7c<BR>Subject: [Eeglablist] Extracting Phase Angle from ITC Matrix<BR>Message: 1</DIV>
<DIV>--001636b148eafdf2820479264a7c<BR>Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1</DIV>
<DIV>Hey everyone,</DIV>
<DIV>I'm wondering whether anyone knows how to extract an estimate of phase angle<BR>(or average phase angle) from the newtimef ITC output matrix.  When I look<BR>at the matrix, I can see that the estimates in each cell are provided in<BR>complex number form - does part of this number pertain to phase angle for<BR>that frequency and time point?  Any help or information would be greatly<BR>appreciated!</DIV>
<DIV>Many thanks,<BR>Zach</DIV>
<DIV><BR> </DIV></td></tr></table><br>