<html><body bgcolor="#FFFFFF"><div>Dear Marine,</div><div><br></div><div>When you use newtimef in this way to compare conditions, the function recomputes a common baseline between the two conditions (you can disable that feature if you want). This explains the difference you observe.</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Arno<br><font class="Apple-style-span" color="#0023A3"><font class="Apple-style-span" color="#000000"><br></font></font></div><blockquote type="cite"><div><br><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Marine Vernet</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:mvernet@bidmc.harvard.edu"><a href="mailto:mvernet@bidmc.harvard.edu">mvernet@bidmc.harvard.edu</a></a>></span><br>
Date: Sun, Jul 3, 2011 at 3:16 PM<br>Subject: [Eeglablist] newtimef question<br>To: <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu"><a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a></a><br><br><br>Dear all,<br><br>Using the newtimef function to compare different datasets, I realized that the results of one dataset were not constant when compared with various datasets.<br>
<br>For example, I obtained different plots (and different values within the output variable) for <b>dataset1</b> in the three cases below:<br>
<br>    <b>erps1=newtimef( {dataset1  dataset2}</b>, 1160, [-200  599], 1450, 0, 'topovec', 27, 'elocs', dataset1.chanlocs, 'chaninfo', dataset1.chaninfo,...<br>        'baseline',[-200 0], 'plotphase', 'off', 'padratio', 1,'freqs',[8 50],...<br>

        'erspmax',3,'itcmax',1,'erplim',[-20 20],'itcavglim',[0 0.6],'speclim',[-15 5],'erspmarglim',[-5 6],... <br>        'alpha', 0.05);<br>    <br>    <b>erps2=newtimef( {dataset1  dataset3}</b>, 1160, [-200  599], 1450, 0, 
'topovec', 27, 'elocs', dataset1.chanlocs, 'chaninfo', 
dataset1.chaninfo,...<br>
        'baseline',[-200 0], 'plotphase', 'off', 'padratio', 
1,'freqs',[8 50],...<br>
        'erspmax',3,'itcmax',1,'erplim',[-20 20],'itcavglim',[0 
0.6],'speclim',[-15 5],'erspmarglim',[-5 6],... <br>
        'alpha', 0.05);<br><br>    <b>erps3=newtimef(dataset1</b>, 1160, [-200  599], 1450, 0, 
'topovec', 27, 'elocs', dataset1.chanlocs, 'chaninfo', 
dataset1.chaninfo,...<br>
        'baseline',[-200 0], 'plotphase', 'off', 'padratio', 
1,'freqs',[8 50],...<br>
        'erspmax',3,'itcmax',1,'erplim',[-20 20],'itcavglim',[0 
0.6],'speclim',[-15 5],'erspmarglim',[-5 6],... <br>
        'alpha', 0.05);<br><br>I there any reason for that?<br><br>Thanks in advance for your help,<br><br>Best regards,<br><br>Marine<br><font color="#888888">
<br>
<br><br clear="all"><br>-- <br>Marine Vernet, PhD<br><br>Berenson-Allen Center for Noninvasive Brain 
Stimulation<br>Beth Israel Deaconess Medical Center, Harvard Medical 
School<br><br><a href="mailto:mvernet@bidmc.harvard.edu" target="_blank"><a href="mailto:mvernet@bidmc.harvard.edu">mvernet@bidmc.harvard.edu</a></a><br><br>
</font><br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank"><a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a></a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu"><a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a></a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu"><a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></a><br></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Scott Makeig, Research Scientist and Director, Swartz Center for Computational Neuroscience, Institute for Neural Computation & Adj. Prof. of Neurosciences, University of California San Diego, La Jolla CA 92093-0559, <a href="http://sccn.ucsd.edu/~scott" target="_blank"><a href="http://sccn.ucsd.edu/~scott">http://sccn.ucsd.edu/~scott</a></a><br>

</div></blockquote></body></html>