Max<div><br></div><div>I have observed that when the data are not full rank.   You can test the rank of your data by reshaping your epoched data to a 2D matrix, and running the rank command, like this:</div><div><br></div>

<div>rank(reshape(EEG.data,EEG.nbchan,EEG.trials*EEG.pnts))</div><div><br></div><div>When I did this, your rank is 63, but you have 69 channels, indicating that some channels are linearly dependent on others.  I think this is the source of your problem, and if you remove those channels before running ICA, you should no longer see this issue.</div>

<div><br></div><div>Best</div><div><br></div><div>John</div><div><br></div><div><br></div><div><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 23, 2011 at 07:24, Maximilien Chaumon <span dir="ltr"><<a href="mailto:maximilien.chaumon@gmail.com">maximilien.chaumon@gmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">Hi eeglabbers,<br><br>I sometimes get ICs with extremely similar topographies and time courses, like on <a href="http://oszilla.hgs.hu-berlin.de/public/Similar_ICs.PNG" target="_blank">this slide</a>.<br>

I know that ICA returns independent components.<br>

Does that not mean that they should not look the same?<br>I know the components are independent in a statistical sense, which is not 
the same as uncorrelated, but still. I'm a bit surprised. What do these two components mean if they cancel one another? well, do they?<br><br>Sorry if my question is naive, but what is happening?<br><br>The data is <a href="http://oszilla.hgs.hu-berlin.de/public/Similar_ICs.mat" target="_blank">here</a>.<br>



<br>Best,<br>Max<br>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>