<html><head><base href="x-msg://522/"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Dear Justine,<div><br></div><div>yes, the GSN-HydroCel-129.sfp is the standard EGI file (128 channel + Cz reference). </div><div>Simply delete the channel you have removed in this file and you will be able to use it directly in topoplot</div><div><br></div><div>topoplot(x,'GSN-HydroCel-129_reduced.sfp');</div><div><br></div><div>Arno</div><div><br><div><div>On Oct 11, 2011, at 8:00 AM, VANDYKE, JUSTINE wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div class="WordSection1" style="page: WordSection1; "><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">I am trying to plot a PCA derived spatial factor in Matlab. I have PCA toolkit, EEGlab, and Fieldtrip folders downloaded and included in the path.<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">In the past, I have worked with a 64 Channel Neuroscan cap, and I have used the following commands (in Matlab):<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">x = FacPat(:,1);<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">topoplot(x,'Neuro64.loc');<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">This time, I used a 128-channel EGI HydroCel net; however, for the PCA, I excluded channels 127 and 128. That leaves 126 recording electrodes and 1 reference electrode (Cz).<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">I saw in EEGLab that there is a GSN-HydroCel-129.sfp file under ‘sample locs’.<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">I was wondering if I can adapt this/use this somehow to plot my spatial factors. If so, I was wondering if someone could help me with this. I tried simply deleting the channels I am not using and saving the file (as a .loc), but this does not work (using the topoplot function).<o:p></o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; "><o:p> </o:p></div><div style="margin-top: 0in; margin-right: 0in; margin-left: 0in; margin-bottom: 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">Thanks!<o:p></o:p></div></div>_______________________________________________<br>Eeglablist page:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" style="color: blue; text-decoration: underline; ">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>To unsubscribe, send an empty email to<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" style="color: blue; text-decoration: underline; ">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></div></blockquote></div><br></div></body></html>