<p>You will get eyeblink IC s even with eye channel removal.</p>
<p>You should get near-eqivalent solutions whether or not you include eye channels.</p>
<p>Some groups isolate and use only the IC of interest, either focusing on IC activation, or backprojecting only that single IC.</p>
<p>Rereferencing without eye channels will still include some inevitable eye activity picked up by other frontal channels. </p>
<p>Comparing several rereferencing schemes, and comparing your results across these schemes, will probably be most educative.</p>
<p>Whole head coverage in current systems is not true whole head coverage. Systems that </p>
<p>Please be sure to post your final solution when you can.</p>
<div class="gmail_quote">On Feb 10, 2012 12:15 PM, "Matthew Stief" <<a href="mailto:ms2272@cornell.edu">ms2272@cornell.edu</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Thanks to all the responses so far!<br>
<br>
I am using a 128 channel BioSemi ActiveTwo system, so the eye channels<br>
are not bipolar.  I imported with a reference to the linked mastoids,<br>
and would like to rereference to the average.  My worry was the one<br>
raised by Simon-Shlomo below, which is whether or not the extra<br>
artifactual activity in the eye channels would contaminate the other<br>
channels.<br>
<br>
This possibility, I gather, is balanced against the goal of having as<br>
many electrodes covering the head as completely as possible to match<br>
the assumption of average referencing as closely as possible, as Robin<br>
mentioned.<br>
<br>
Makoto, what is your opinion on these two issues?  I am planning on<br>
running ICA, not for artifact detection but to isolate the P1, and was<br>
planning on including the eye channels to better separate out those<br>
those artifactual sources.  And just to be sure I understand you, you<br>
are saying that if I rereference to the average of only the 128 scalp<br>
electrodes, and then run ICA on all 132 electrodes, that ICA will<br>
average reference the data to all 132 electrodes again?  I believe I<br>
remember reading that referencing after epoching and baseline removal<br>
is erroneous, so how is that possible?<br>
<br>
<br>
<br>
On Thu, Feb 9, 2012 at 5:15 PM, Simon-Shlomo Poil<br>
<<a href="mailto:poil.simonshlomo@gmail.com">poil.simonshlomo@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Dear Matthew,<br>
><br>
> I would recommend you not to include your eye channels in your average<br>
> reference.  If you still have eye-blinks in these channels, they will<br>
> just contaminate your other channels.<br>
><br>
> (If you already removed your eye-blinks using ICA, it's probably ok to<br>
> include them in the average reference.)<br>
><br>
> -Simon-Shlomo Poil<br>
><br>
><br>
> 2012/2/9 Matthew Stief <<a href="mailto:ms2272@cornell.edu">ms2272@cornell.edu</a>>:<br>
>> Greetings!<br>
>><br>
>> I am using a 128 channel BioSemi active system, and am importing my<br>
>> files using the average mastoids as the reference.  I would like to<br>
>> rereference to the average, but am unsure if I should use my four eye<br>
>> electrodes.  I read in the archives that this shouldn't be done for<br>
>> eye electrodes that do not have the same reference as the scalp<br>
>> electrodes, but given that in this case they do is there any reason<br>
>> not to do it?<br>
>><br>
>> --<br>
>> _________________________________________________________________<br>
>> Matthew Stief<br>
>> Human Development | Sex & Gender Lab | Cornell University<br>
>> <a href="http://www.human.cornell.edu/HD/sexgender" target="_blank">http://www.human.cornell.edu/HD/sexgender</a><br>
>><br>
>><br>
>> Heterosexuality isn't normal, it's just common.<br>
>> -Dorothy Parker<br>
>> _______________________________________________<br>
>> Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
>> To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
>> For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
> Simon-Shlomo Poil<br>
><br>
> Webpage: <a href="http://www.poil.dk/s/" target="_blank">http://www.poil.dk/s/</a> and <a href="http://www.nbtwiki.net" target="_blank">http://www.nbtwiki.net</a><br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
_________________________________________________________________<br>
Matthew Stief<br>
Human Development | Sex & Gender Lab | Cornell University<br>
<a href="http://www.human.cornell.edu/HD/sexgender" target="_blank">http://www.human.cornell.edu/HD/sexgender</a><br>
<br>
<br>
Heterosexuality isn't normal, it's just common.<br>
-Dorothy Parker<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote></div>