<p>Leave questionable electrodes out before ica.<br>
If you have a sparse electrodes array, dont be draconian. some of my best decompositions come with discounting up to 40% sometimes, although I prefer not to remove more than 25% or so.</p>
<p> Interpolate if you must after ICA. <br>
After decomposition, Normal ic analyses should not require interpolation, unless you need equivalent scalp maps across ICs, or you are backprojecting to scalp/erp land.</p>
<p>You could run a second Ica yourself, after interpolation, to see what happens to extant IC s<br>
in a new, second decomposition. </p>
<p>Please try  be sure to feed your final conclusions back to the list.<br>
</p>
<div class="gmail_quote">On Feb 18, 2012 12:50 PM, "Matthew Stief" <<a href="mailto:ms2272@cornell.edu">ms2272@cornell.edu</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Greetings!<br><br>I was wondering if anyone could weigh in on some (as far as I can tell) outstanding issues in how to optimally deal with removed channels before ICA.<br><br>The remaining question seems to me to be this: is it superior to A) interpolate the removed channels, run PCA to appropriately reduce the dimensionality of the data, and then run ICA, or B) simply leave the electrodes out and interpolate after running ICA.<br>

<br>With the fact in mind that both the interpolation and the PCA introduce non-linearities into the data, is it the case that the addition of the new "clean" interpolated channels provides additional data deriving from neural sources for the ICA to work with, or does the fact that it's just a combination of data from other electrodes negate this possibility?  The negative to the interpolation/PCA approach is clear, and may not be very substantial, but is there evidence for any positive at all?<br clear="all">

<br>-- <br>_________________________________________________________________<br>Matthew Stief<br>Human Development | Sex & Gender Lab | Cornell University<br><a href="http://www.human.cornell.edu/HD/sexgender" target="_blank">http://www.human.cornell.edu/HD/sexgender</a><br>

<br><br>Heterosexuality isn't normal, it's just common.<br>-Dorothy Parker<br>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div>