<span class="Apple-style-span" style="border-collapse:collapse"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">I am trying to run the a script in EEGLAB version 10_2_5_8b
which has run successfully in the past with EEGLAB version 7_1_3_12b.<span style>   </span>I have run into a few problems
that I have noted below.<span style>  </span>Please
let me know if you have any insight into why these lines are not functioning
properly.</font></span></span><span class="Apple-style-span" style="border-collapse:collapse">


















<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">First, I am trying to run binica in linux but it is not working.
 I performed the same steps as I had done previously with eeglab7_1_3_12b:
changing icadefs.m to ica_linux and setting the path to the ica_linux
executable file in both Matlab and my bash profile.  Is there something
different I need to do to run binica in eeglab10_2_5_8b?</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">Second, a problem occurs when I try to select datasets to
run ICA on.<span style>  </span>When I run the
following code using the selected datasets ICA runs but does not save the ICA
weights.<span style>  </span>When I reload the
datasets the ICA weights are not there.<span style> 
</span>If I restart EEGLAB and load only the datasets I want to run ICA on and
run ICA with all datasets selected it works fine.</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">%Selects datasets to run ICA on</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">allcleandatasets = [];</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">for datasets = 1: length(subjects)</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"><span style>            </span>datasets
= datasets - 1;</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"><span style>            </span>subjectcleandataset
= [1:2:11];</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"><span style>            </span>allcleandatasets
= cat(2, allcleandatasets, subjectcleandataset);</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">end</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">%Concatenates each subjects condition datasets and runs ICA</font></span></p>



<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">[ALLEEG EEG CURRENTSET] = pop_newset(ALLEEG, EEG,
CURRENTSET, 'retrieve', allcleandatasets , 'study',0); </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">EEG = eeg_checkset( EEG );</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">EEG = pop_runica(EEG,<span style> 
</span>'icatype', 'binica', 'concatcond', 'on', 'options',{ 'extended',1});</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">[ALLEEG EEG] = eeg_store(ALLEEG, EEG, CURRENTSET);</font></span></p>



<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">EEG = pop_saveset( EEG,<span style>  </span>'savemode', 'resave');</font></span></p>



<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">Third, a problem occurs when I try to create the
STUDY.<span style>  </span>When I run it through the
GUI it works fine but when I run the following code (saved directly from eegh()) I get the following
errors: </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">Important warning: some datasets do not have subject codes;
some functions may crash!</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">Important warning: some datasets do not have condition
codes; some functions may crash!</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">When I double check the dataset information all the codes
are there.</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">%Creates STUDY</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">%NEED TO CHANGE THE NAME OF STUDY</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">Study = ‘KAHN5’</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">studyoutputfilename = [Study,'.study'];</font></span></p>



<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">studyoutputFile = fullfile(dataroot);</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">%[STUDY, ALLEEG] = std_checkset(STUDY, ALLEEG);</font></span></p>



<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">[STUDY ALLEEG] = std_editset( STUDY, ALLEEG,<span style>  </span>'name', Study, 'updatedat', 'on',
'savedat', 'on' );</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">CURRENTSTUDY = 1; EEG = ALLEEG; CURRENTSET =
[1:length(EEG)];</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">[STUDY EEG] = pop_savestudy( STUDY, EEG,<span style>  </span>'filename', studyoutputfilename,
'filepath', studyoutputFile);</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span class="Apple-style-span" style="background-color:rgb(255,255,255)"><font class="Apple-style-span" face="arial, helvetica, sans-serif">CURRENTSTUDY = 1; EEG = ALLEEG; CURRENTSET =
[1:length(EEG)];</font></span><font class="Apple-style-span" color="#222222" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"></font></p>



<p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;color:rgb(34,34,34)"><br></p></span><div>-- <br>Erika Nyhus, Ph.D.<br>Cognitive, Linguistic, and Psychological Sciences<div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;border-collapse:collapse"><div>

Brown University </div>
190 Thayer St.<div><div>Providence, RI 02912-1821</div></div></span></div><br>
</div>