Dear Makoto,<br>
<br>
thank you for your answer, it cleared the doubts in my head regarding 
this =). As I understood, the purpose of Baseline Removal is for me/us 
to have better insight when event in observed epoch happened, so the 
value around corresponding marker is expected to be zero. Right?<br>
<br>
I have one more question regarding this - does it matter if I Remove 
Baseline for example (-1000ms to 0ms) if I have epoch that is longer (-4
 secs to 4 secs)? I read in Q&A list Arno's answer regarding similar
 question where he said that ICA can be unstable if the epochs baseline 
is too short, so he suggests longer baselines (i.e 1 sec).<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Ida<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, May 10, 2012 at 9:45 PM, Makoto Miyakoshi <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Dear Ida,<br>
<br>
The consequence would be that you may not have near-zero potential<br>
at/around time zero (and this time zero which should be an onset of<br>
whatever event). Usually people want to reset their data to zero<br>
microvolt at/around time zero, so they subtract mean of short time<br>
period immediately before it (for example, -200 ms to 0 ms as a<br>
baseline period). Am I answering to your question? If not, let me<br>
know.<br>
<br>
Makoto<br>
<br>
2012/5/10 ida miokovic <<a href="mailto:ida.miokovic@gmail.com">ida.miokovic@gmail.com</a>>:<br>
<div><div class="h5">> Hello everyone,<br>
><br>
> Since I do not have experience in eeg signal processing, I am asking you for<br>
> the opinion regarding epoch baseline removal (a window for this pops up<br>
> after I do the data epoching). Epochs I am extracting are quite long: -4<br>
> secs before and 4 secs after Marker of my interest.<br>
><br>
> Why is following suggested in tutorial:<br>
><br>
> "Using the mean value in the pre-stimulus period (the pop_rmbase() default)<br>
> is effective for many datasets, if the goal of the analysis is to define<br>
> transformations that occur in the data following the time-locking events."<br>
><br>
> What are the consequences if I leave the fields in pop up window (Epoch<br>
> Baseline Removal) empty and therefore have the whole epoch used as a<br>
> baseline?<br>
><br>
> Thank you in advance,<br>
><br>
> All the best,<br>
><br>
> Ida<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
> To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
> For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to<br>
> <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
<br>
--<br>
Makoto Miyakoshi<br>
JSPS Postdoctral Fellow for Research Abroad<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</font></span></blockquote></div><br>