<div>Greetings M,</div><div><br></div><div>***we could use an opinion from an ICA/PCA expert here, but here are some thoughts. *******</div><div>I have tried to keep it as clear, simple, and (hopefully) useful as possible.</div>

<div><br></div><div>I assume you have done some cleaning before running your first ICA, </div><div>as per general pre-ICA guidelines.</div><div>If so, then your sequence of </div><div>first ICA, then reject some epochs using IC data, </div>

<div>then second ICA, then remove some bad components...</div><div>seems OK. This seems like a normal processing procedure.</div><div><br></div><div>So now you can analyze specific ICs,</div><div>or you can "reconstruct" your eeg data using only the remaining ICs, </div>

<div>and have "cleaner" EEG data for "normal" EEG analyses.</div><div><br></div><div>imho, I don't see why you want to re-run the ICA again now for the third time.</div><div>If you do, you might get a slightly better decomposition, </div>

<div>but there should not be a significant change of ICs.</div><div><br></div><div>on your question about PCA, perhaps one of the experts can make a suggestion,</div><div>but from my understanding, the PCA option is used when </div>

<div>A. the "dimensionality" and/or the "rank" of the data has been reduced via some method, </div><div>and you want ICA to know this before running a new decomposiiton</div><div>B. or you want to "reduce" the total number of dimensions that ICA generates, </div>

<div>for some other good reason. [see published articles on this point]</div><div><br></div><div>Last, I want you to know I am not 100% sure about whether or not you "have to" run ICA with PCA options</div><div>

when you are re-running ICA after having "dropped/removed" some components. </div><div>one previous eeglab list discussion:</div><div><a href="http://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2012/004543.html">http://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2012/004543.html</a></div>

<div><br></div><div>Good luck and let the list know of your success.</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div>