<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">I am trying to run AMICA for the first time and am running in to some trouble. I am using a cluster running Kubuntu 64-bit with SGE installed.</span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">

<br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">I downloaded the amica12lnx64 binary and have runamica12.m in my path. I loaded a .set file and executed "<span style="font-size:medium;font-family:'Times New Roman'">[ EEG.icaweights, EEG.icasphere, mods ] = runamica12( EEG.data(:,:) )"</span></div>

<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px"><span style="font-size:medium;font-family:'Times New Roman'"><br></span></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">

I received the following on the command line:<br><br>mpich is not a parallel environment<br>orte is not a parallel environment<br>Using make parallel environment.<br>Writing data file: /dreamio2/banichlab/studies/VTS/eeg/VTS_ERP2/tmpdata91338.fdt<br>

bash: dreamio4: command not found<br>Please disregard any Warnings about X11 forwarding.<br>qsub id = <br>You can watch the last 25 lines of the output with:<br>   $ watch tail -n 25 qsub.sh.o<br>or in Matlab:<br>   >> system('watch tail -n 25 qsub.sh.o')<br>

You can load the output as it's running by typing:<br>   >> mods = loadmodout12('/dreamio2/banichlab/studies/VTS/eeg/VTS_ERP2/amicaouttmp/')<br>Error in ==> runamica12 at 101<br>binfile = 'amica12lnx64';<br>

<br>??? Output argument "weights" (and maybe others) not assigned during<br>call to<br>"/dreamio2/banichlab/studies/VTS/eeg/toolboxes/runamica12.m>runamica12".<br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13.333333969116211px">

 <br>Do I need to set up additional files to get AMICA to run?<br><br>Thanks in advance,<br>Joe</div>