
<html><head><base href="x-msg://1091/"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Dear Aleksandra,<div><br></div><div>this is currently not possible from the GUI. As always it is possible from the command line though.</div><div><br></div><div><i>% merge all channel location structures for the STUDY</i></div><div><i>mergelocs = eeg_mergelocs(ALLEEG.chanlocs);</i></div><div><i><br></i></div><div><i>% parameters for headplot. IMPORTANT NOTE: the transformation matrix depends on your montage.</i></div><div><i>% to find the correct transformation matrix, plot the 3-D head on one of the subject and look at the transformation matrix<br>headplotparams = { 'meshfile', 'mheadnew.mat', 'transform', [-1.1546 -7.0388 -31.3728 -0.034649 0.020976 -1.5343 96.2507 92.8068 117.9186] };<br><br></i></div><div><i>% set up the spline file</i></div><div><i>headplot('setup', mergelocs, 'STUDY_headplot.spl', headplotparams{:});<br> <br>% get ERSP results (scalp maps) - for example scalp topography of spectrum in the alpha band</i></div><div><i>[STUDY spec ] = std_specplot(STUDY,ALLEEG,'channels', { mergelocs.labels }, 'topofreq', [8 12]);<br><br></i></div><div><i>% average subject and plot using headplot</i></div><div><i>scalp_spec = mean(spec{1},3);</i></div><div><i>figure; headplot(scalp_spec, 'STUDY_headplot.spl', headplotparams{:}, 'maplimits', 'maxmin');</i></div><div><br></div><div>Why aren't we putting it in the GUI? Beside resources (it is one thing to write code quickly in an email and another to write a GUI), this version of headplot is becoming obsolete (although there has been improvements over the years, it is about 15 years old now). Alejandro Ojeda in our lab has developed a better version (nicer graphics) that we hope to integrate in EEGLAB one day.</div><div><br></div><div>Arno</div><div><br></div><div>ps: Unfortunately, you cannot plot ICA cluster topographies using this method.</div><div><br><div><div>On 5 Jan 2013, at 04:59, Aleksandra Vuckovic wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div ocsi="x"><div style="font-family: Tahoma; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); font-size: x-small; "><div></div><div dir="ltr"><font color="#000000" size="2" face="Tahoma">Hi,</font></div><div dir="ltr"><font face="tahoma">can somebody help me how to produce 3D<a></a><span class="Apple-converted-space"> </span>scalp maps in STUDY, as one we can make for a single subject?</font></div><div dir="ltr"><font face="tahoma">Many thanks,</font></div><div dir="ltr"><font face="tahoma">Aleksandra</font></div></div>_______________________________________________<br>Eeglablist page:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>To unsubscribe, send an empty email to<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></div></blockquote></div><br></div></body></html>