
<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Dear T. Almabruk,<div><br></div><div>the original paper describes the computation of coherence</div><div><br></div><div><a href="http://sccn.ucsd.edu/~arno/mypapers/DelormeEEGLAB2004.pdf">http://sccn.ucsd.edu/~arno/mypapers/DelormeEEGLAB2004.pdf</a></div><div><br></div><div>The Matlab mscohere function extracts windows in your data and uses the average to compute coherence, so it needs to be applied to continuous data. By contrast the EEGLAB function you are using assumes the windows have been extracted (it assumes data epochs). Otherwise the result should be the same as I think mscohere computes phase coherence and is also bounded between 0 and 1. If someone on the list would not mind to check, that would be a worthwhile exercise.</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Arno</div><div><br><div><div>On 13 Feb 2013, at 00:43, T. Almabruk wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">

<div><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:14pt"><div style="RIGHT: auto">Hello</div>

<div style="RIGHT: auto">I have a question about using eeglab to compute coherence between two signals.</div>

<div style="RIGHT: auto">I followed these steps: plot-> time-frequency transform -> component cross-coherence.</div>

<div style="RIGHT: auto">the figure i got it is not understandable for me. i mean i expect that i'll have a figure represents the coherence. but i got two curves and i don't know which one represents the coherence and when i computed the coherence by <font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"></font></font></font></div><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#228b22" size="2" face="Courier New">

<div>mscohere <font color="#000000">and plot the result i can see no similarity between this result and eeglab result.</font></div>

<div><font color="#000000">i think i misunderstand something.Can i get some help please.</font></div>

</font></font></font><div><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#228b22" size="2" face="Courier New"><font color="#000000">Cheers,<var id="yui-ie-cursor"></var></font></font></font></font></div></div></div>_______________________________________________<br>Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></blockquote></div><br></div></body></html>