<div dir="ltr">Dear Dr. Gonzales,<div><br></div><div style>I suppose you mean you compare phases between channels and ICs. It's not shift that makes difference between scalp channel ICs and EEGs. Let me explain what it is. Let's say we have only 2 channels and 2 ICs. The relation of scalp channel EEG and ICs are like this:</div>

<div style><br></div><div style>Channel 1 = 0.3 X IC1 + 0.7 X IC2</div><div style>Channel 2 = 0.7 x  IC1 + 0.3 x IC2</div><div style><br></div><div style>Here I determined 0.3 and 0.7 arbitrarily but actually these are determined by ICA. Anyway, when you compare Channel 1 with IC1 in the above example, they are dissimilar to each other NOT because of phase shift (unless IC1 and IC2 are similar, which is hard to imagine since they are supposed to be temporally independent).</div>

<div style><br></div><div style>If the decomposition is like</div><div style><br></div><div style><div>Channel 1 = 0.99999 X IC1 + 0.00001 X IC2</div><div>Channel 2 = 0.00001 x  IC1 + 0.99999 x IC2</div></div><div style>
<br>
</div><div style>Then your Channel 1 and IC1 should be very similar.</div><div style><br></div><div style>Makoto</div><div style><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2013/4/3 karlo gonzales <span dir="ltr"><<a href="mailto:thats_karlo@yahoo.com" target="_blank">thats_karlo@yahoo.com</a>></span><br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:10pt;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><div><div><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">

<div style="font-size:10pt;font-family:arial,helvetica,sans-serif">Dear Dr.<span style="font-size:small;color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;line-height:16px"> </span><i>Miyakoshi,</i></div><div style="font-style:normal;font-size:13px;background-color:transparent;font-family:arial,sans-serif">

<i><br></i></div><div style="background-color:transparent"><span><span><font><i><span><span style="line-height:16px">I am using  EEGLAB and ICA tools to clean EEG data. i am recording  EEG from a 64 channel cap (NEUROSCAN), with  a fixed reference electrode, which is  located between CZ and CPZ. </span></span></i></font></span></span></div>

<div style="background-color:transparent"><font face="arial, sans-serif"><i><span style="line-height:16px">i do not re-reference my data for further analysis.</span></i></font><i style="line-height:16px;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif;background-color:transparent"> So, i just wonder, if applying ICA, would shift the phase of signals (specially low frequency)? is there anyway to check it? </i></div>

<div style="background-color:transparent"><i style="line-height:16px;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif;background-color:transparent"><br></i></div><div style="background-color:transparent"><i style="line-height:16px;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif;background-color:transparent">many many thanks for all your help and support,</i></div>

<div style="background-color:transparent"><i style="line-height:16px;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif;background-color:transparent">Karlo</i></div><div style="background-color:transparent"><span><span><font><span style="line-height:16px"><i><br>

</i></span></font></span></span></div><div style="font-size:10pt;background-color:transparent;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><span><span style="line-height:16px;font-style:italic;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif"><br>

</span></span></div><div style="font-size:10pt;background-color:transparent;font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br></div><div style="font-style:italic;font-size:13px;background-color:transparent;font-family:arial,sans-serif">

<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;font-style:italic;line-height:16px;background-color:transparent"><br></span></div><div style="font-style:normal;font-size:13px;background-color:transparent;font-family:arial,sans-serif">

<span><span style="line-height:16px;font-style:italic;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif"><br></span></span></div><div style="font-style:italic;font-size:13px;background-color:transparent;font-family:arial,sans-serif">

<span><span style="line-height:16px;font-style:italic;font-size:13px;font-family:arial,sans-serif"><br></span></span></div></div></div></div></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">

Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div>
</div>