<div dir="ltr"><div><span class="Apple-style-span" style="border-collapse:collapse;font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Hi,</span><br></div><span class="" style="border-collapse:collapse;font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><div>
I have two questions about the function std_envtopo.m </div><div><br></div><div>First, I was wondering wether I could use something like the 'plotchans' (available in envtopo) to compute the contributions in just one or a few channels of interest. The default function computes the contributions for the grand ERPs which gives me a lot of variability that I'm not interested in.</div>
<div><br></div><div>Also, I'm still confuse about the pvaf for the individual clusters. </div><div>For example, I'm looking for the clusters that explain the P300 variability and there is a cluster (out of 7 clusters) that seems to me (based on the cluster's ERP) that explains most of the variability of the P300. </div>
<div>When I run std_envtopo, I get a pvaf of -550.46 for that cluster. First, I understand that this is not talking about the P300 activity alone, but the grand average, and this implicates a lot of variance from many areas that I'm not interested in (and this is the reason why I'm trying to use just a few channels of interest). Therefore, because what I think is the 'P300 cluster' may have a different signal than all the other activities (that I'm not interested in), then I get a negative value for this cluster pvaf (-550.46). Am I getting something wrong so far?</div>
<div><br></div><div>Also, I imagine that, because this is the percent variance accounted for, for positive numbers, 100 should be the maximum possible value?</div><div><br></div><div>I hope that makes sense. Thanks in advance for your help.</div>
<div>Ana</div></span></div>