<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle"><!--P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
--></style>
</head>
<body fPStyle="1" ocsi="0">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; DIRECTION: ltr; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 10pt">
<p>Thanks for all of the help.</p>
<p> </p>
<p>Is there a way to highlight a channel from the 'stacked' view of the channels? So that when I view the channels in the 'stacked' view and there is a clear outlier I can select that and know which channel to remove? For example, in the attached, what is the
 easiest way to find out the number of the channel with the much larger waveform?</p>
<div>
<p> </p>
<p>thanks,</p>
<p>katherine</p>
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-SIZE: 13px"></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div style="FONT-FAMILY: Times New Roman; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div style="DIRECTION: ltr" id="divRpF645151"><font color="#000000" size="2" face="Tahoma"><b>From:</b> James Desjardins [jdesjardins@brocku.ca]<br>
<b>Sent:</b> 15 April 2013 16:14<br>
<b>To:</b> Katherine Naish; eeglablist@sccn.ucsd.edu<br>
<b>Subject:</b> RE: Manually marking bad channels<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; DIRECTION: ltr; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 10pt">
Hi Katherine,<br>
<br>
At the bottom of the EEGLab <font face="Courier New">Edit</font> menu there is an option for "visual edit...". This will open the eegplot figure with a couple extra capabilities. If you then
<font face="Courier New">ctrl/left-click</font> on the eegplot figure a GUI will pop up allowing you to flag the channel (or edit events). simply select the "toggle bad channel status" and then press
<font face="Courier New">OK</font>.<br>
<br>
This functionality is not yet fully integrated into EEGLab (although I am almost finish testing an integrated prototype) and it simply edits a
<font face="Courier New">badchan</font> field in the <font face="Courier New">EEG.chanlocs</font> structure. There are no GUI options yet for handling these flags, but from the command line you can use:<br>
<br>
<font face="Courier New">EEG = eeg_interp(EEG,find([EEG.chanlocs.badchan]),'spherical');<br>
EEG = eeg_checkset( EEG );<br>
</font><br>
to interpolate the flagged channels,<br>
<br>
or:<br>
<br>
<font face="Courier New">EEG = pop_select( EEG,'nochannel',{EEG.chanlocs(find([EEG.chanlocs.badchan])).labels});<br>
EEG = eeg_checkset( EEG );<br>
</font><br>
<div>to remove the flagged channels.<br>
<br>
<br>
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="FONT-SIZE: 10pt">
<div class="PlainText">James Desjardins, MA<br>
Electrophysiology Technologist<br>
Cognitive and Affective Neuroscience Lab, Psychology Department <br>
Jack and Nora Walker Centre for Lifespan Development Research<br>
Brock University<br>
500 Glenridge Ave.<br>
St. Catharines, ON, Canada L2S 3A1<br>
905-688-5550 x4676<br>
--<br>
"'Cause you never can tell What goes on down below!<br>
"This pool might be bigger Than you or I know!"<br>
<br>
McElligot's Pool<br>
Dr.Seuss 1947</div>
</span></font></div>
</div>
</div>
<div style="FONT-FAMILY: Times New Roman; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div style="DIRECTION: ltr" id="divRpF718678"><font color="#000000" size="2" face="Tahoma"><b>From:</b> eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu [eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu] on behalf of Katherine Naish [K.R.Naish@pgr.reading.ac.uk]<br>
<b>Sent:</b> April-13-13 9:21 AM<br>
<b>To:</b> eeglablist@sccn.ucsd.edu<br>
<b>Subject:</b> [Eeglablist] Manually marking bad channels<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; DIRECTION: ltr; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 10pt">
<div>
<p>Is there a way to select channels for rejection (for example, when using pop_eegplot)? I have been using pop_rejchan to automatically mark channels and reject them that way, but is there a way to manually mark for rejection based on visual inspection, as
 can be done with epochs?</p>
<p> </p>
<p>Thanks for your help,</p>
<p>katherine</p>
<p> </p>
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-FAMILY: Tahoma; FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-SIZE: 13px">-------------------------------</div>
<div style="FONT-SIZE: 13px">Katherine Naish</div>
<div style="FONT-SIZE: 13px">School of Psychology</div>
<div style="FONT-SIZE: 13px">University of Reading & Goldsmiths University of London</div>
<div style="FONT-SIZE: 13px">+44(0)118 378 6946</div>
<div style="FONT-SIZE: 13px"><a href="http://www.neurobiography.info/handlab.php?page=people#Katherine-Naish" target="_blank">http://www.neurobiography.info/handlab.php?page=people#Katherine-Naish</a></div>
<div style="FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-SIZE: 13px">
<div style="FONT-SIZE: 13px"></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>