<font class="Apple-style-span" color="#333399">Greetings Mikolaj,</font><div><font class="Apple-style-span" color="#333399"><br></font></div><div><font class="Apple-style-span" color="#333399">imho, your strategy of interpolating channels after </font><span class="Apple-style-span" style="color:rgb(51,51,153)">cleaning your data, removing bad channels, running ICA, removing some artifactual ICs, </span></div>

<div><font class="Apple-style-span" color="#333399">rebuilding the EEG without those artifactual ICs [you did not mention this step but I assume you are doing it]</font></div><div><font class="Apple-style-span" color="#333399">and then </font><span class="Apple-style-span" style="color:rgb(51,51,153)">interpolating the missing channels, </span><span class="Apple-style-span" style="color:rgb(51,51,153)">sounds fine, altogether. </span></div>

<div><span class="Apple-style-span" style="color:rgb(51,51,153)"><br></span></div><div><font class="Apple-style-span" color="#333399">However, consider doing your analysis at the IC level, wherein the independent sources in the eeg have been determined.</font></div>

<div><font class="Apple-style-span" color="#333399">Further, it's not clear why there are "only" four bad channels in your sample. In my experience, different participants have slightly different bad channels.</font></div>

<div><font class="Apple-style-span" color="#333399">Also, please note that removing artifactual ICs usually means just removing the "blink IC" and the "lateral eye movement IC".</font></div><div><font class="Apple-style-span" color="#333399">Removing other ICs introduces problems, as some of the weaker ICs often seem like single channels, and throwing any IC out might also involve inadvertantly throwing out brain dynamics related to cognition. A similar issue arises with traditional eye-blink correction techniques that may modify frontal channel activity that is relevant to cognition, and not just eyeblink artifacts.</font></div>

<div><font class="Apple-style-span" color="#333399"><br></font></div><div><font class="Apple-style-span" color="#333399">Wishing you good eeg adventures, </font><span class="Apple-style-span" style="color:rgb(51,51,153)">Tarik</span></div>

<div><font class="Apple-style-span" color="#333399"><br></font></div><div><font class="Apple-style-span" color="#333399"><br></font>
<br><br><div class="gmail_quote">On Sun, May 19, 2013 at 7:11 PM, Mikołaj Magnuski <span dir="ltr"><<a href="mailto:imponderabilion@gmail.com" target="_blank">imponderabilion@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div dir="ltr">Dear EEGLab community,<div><br></div><div>Given that PCA is not recommended before ICA,<br>how to avoid it while still interpolating bad channels?<br><br>My initial analysis of the data is in channel space</div>


<div>so I would like to have all channels for all participants.</div><div>Therefore I want to interpolate bad channels (I have a<br>maximum of 4 bad channels out of 64 per subject).<br>This causes the rank of the data to decrease and compli-</div>


<div>cates using ICA for artifactual components removal.<br><br>Do you think a following way of avoiding PCA before ICA is ok?</div><div>1. preprocess the data before ICA</div><div>2. perform ICA and remove artifactual components</div>


<div>3. interpolate channels</div><div><br></div><div>So, in short: is it valid to interpolate channels only after</div><div>removal of artifactual ICs?<br clear="all"><div><br>Mikolaj M</div>
</div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>