<div dir="ltr">Dear Felix,<div><br></div><div>I had a similar problem previously and could not find the cluster<br>statistics data anywhere in EEGlab structures (perhaps I was<br>not looking carefully enough - Makoto, is FieldTrip output saved<br>

anywhere in the workspace when doing cluster statistics from<br>EEGlab?).<br><br>When doing cluster statistics EEGlab uses another toolbox -<br>FieldTrip. If you are unable to dig up the output of this procedure<br>anywhere in EEGlab I suggest you should perform it in FieldTrip<br>

directly. It's a little bit harder than EEGlab because you don't have<br>a GUI in FieldTrip, but all the functions are described very well and<br>some really helpful tutorials are present on the FieldTrip web page<br>

(the page is here: <a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/" target="_blank">http://fieldtrip.fcdonders.nl/</a>).<br>There is a function called eeglab2fieldtrip that can transform your<br>EEG structure from EEGlab to FieldTrip style. All the following<br>

steps can be done according to:<br><a href="http://fieldtrip.fcdonders.nl/tutorial/cluster_permutation_freq" target="_blank">http://fieldtrip.fcdonders.nl/tutorial/cluster_permutation_freq</a><br><br>I have some functions that could help you along the way<br>

(or even automatise the whole procedure), you can con-<br>tact me if you decide to do cluster statistics directly in <br>FieldTrip. <br>Nevertheless, the FieldTrip output should be present somewhere<br>in the workspace or at least be possible to catch in a script (if not<br>

it is still possible to modify one of the EEGlab functions to return or <br>eval in your base workspace the information about cluster statistics).<br><br>Mikolaj</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div>Pozdrawiam,<br>
Mikołaj Magnuski</div>
<br><br><div class="gmail_quote">2013/6/19 Felix Ball <span dir="ltr"><<a href="mailto:Felix.Ball@hu-berlin.de" target="_blank">Felix.Ball@hu-berlin.de</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Dear list,<br>
<br>
Thank you in advance for your help. I currently try to use the STUDY function and especially the non-parametric test (Maris and Oostenveld cluster statistic). I have an experiment with two conditions and n subjects. What I want to know is at which time points and at which electrodes the two conditions differ from each other. The difference between conditions is investigated on the grand average level.<br>

I read about a method introduced by Maris and Oostenveld and it seems to be perfect for my needs and it is already implemented in EEGLab. What I get with EEGLab (see matlab code) is a plot (see figure C1vsC2) with different time intervals marked in grey for each electrode. These grey shaded areas are, as far as I understood, significant differences between conditions. Furthermore, they are in a time range where I expected to find a significant difference between conditions. Now I have 2 questions:<br>

<br>
1) I want to access the statistics that are the basis of this plot. Does someone know where I can find them or do I have bugs in my code, preventing me from accessing the stats variables? I was not able to find any variable in my workspace resembling the results shown in figure C1vsC2.<br>

<br>
2) The result I expected (after reading the Maris and Oostenveld paper), slightly differs from the result I receive. I expected only one cluster of neighbor electrodes and one continuous time interval to be shaded in grey in the plot. This cluster- time interval combination would be the maximum effect between conditions. However, looking at figure C1vsC2, I see that neighbor electrodes have a grey shaded areas, but these areas are not necessarily continuous and are not equal for all electrodes. If I just look at one electrode, e.g. FC3 (see appendix), I see that the time range is sometimes interrupted. How do I know when conditions start and stop to be significantly different, if there is not only one time interval of significant difference? I need to know the time range because I want to pick the mean amplitude (in the time range) for a regression analysis.<br>

<br>
Thank you for your help and kind regards. felix<br>
<br>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>