<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body dir="auto">
<div>Dear Iman,</div>
<div>Thank you for your response. I played around with Cartool for the last few days and found the software extremely useful. However, it would be great if there was a way to either export the segmentation to Matlab or run the AAHC algorithm directly in Matlab,
 because I would like to process the same data in different ways that depend on Matlab routines and compare the results. </div>
<div><br>
</div>
<div>Yours</div>
<div><br>
</div>
<div>Joe<br>
<br>
<div>____________________________________</div>
Joe Bathelt, MSc
<div>PhD candidate</div>
<div>Developmental Cognitive Neuroscience Unit</div>
<div>UCL Institute of Child Health</div>
<div>+44 020 7905 42749</div>
<div><a href="mailto:johannes.bathelt.10@ucl.ac.uk">johannes.bathelt.10@ucl.ac.uk</a></div>
</div>
<div><br>
On 24 Jul 2013, at 19:08, "Iman M.Rezazadeh" <<a href="mailto:irezazadeh@ucdavis.edu">irezazadeh@ucdavis.edu</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Helvetica;
        panose-1:2 11 6 4 2 2 2 2 2 4;}
@font-face
        {font-family:"MS Mincho";
        panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4;}
@font-face
        {font-family:PMingLiU;
        panose-1:2 2 5 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:PMingLiU;
        panose-1:2 2 5 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@PMingLiU";
        panose-1:2 2 5 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:"\@MS Mincho";
        panose-1:2 2 6 9 4 2 5 8 3 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.apple-style-span
        {mso-style-name:apple-style-span;}
span.apple-converted-space
        {mso-style-name:apple-converted-space;}
span.apple-tab-span
        {mso-style-name:apple-tab-span;}
span.EmailStyle20
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Hi Joe,
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Please see :
</span><span style="font-family:"Calibri","sans-serif""><a href="https://sites.google.com/site/fbmlab/cartool">https://sites.google.com/site/fbmlab/cartool</a> and
<a href="http://www.hindawi.com/journals/cin/2011/813870/">http://www.hindawi.com/journals/cin/2011/813870/</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif"">Also, I have provided an illustrated tutorial about CARTOOL in its online forum.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif""><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif"">Best,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:"Calibri","sans-serif"">Iman<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">Iman M.Rezazadeh, PhD<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">Postdoctoral Research Fellow<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">Center for Mind and Brain<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">University of California, Davis<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><a name="webProfileURL"></a><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="http://www.linkedin.com/pub/iman-m-rezazadeh/10/859/840" title="View public profile"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D;border:none windowtext 1.0pt;padding:0in;background:#F6F6F6">www.linkedin.com/pub/iman-m-rezazadeh/10/859/840</span></a></span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="http://mindbrain.ucdavis.edu/people/imanmr"><span style="font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">http://mindbrain.ucdavis.edu/people/imanmr</span></a></span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">email :
</span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><a href="mailto:irezazadeh@ucdavis.edu"><span style="font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">irezazadeh@ucdavis.edu</span></a></span><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">Tel: 530-297-4444<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">Cell:310-490-1808<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D">Skype: Imanmr<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FA" dir="RTL" style="font-size:8.0pt;font-family:"Arial","sans-serif";color:#1F497D;mso-fareast-language:ZH-TW">ایمان محمد رضازاده</span><span style="font-size:8.0pt;font-family:"PMingLiU","serif";color:#1F497D;mso-fareast-language:ZH-TW"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="ZH-TW" style="font-size:8.0pt;font-family:"PMingLiU","serif";color:#1F497D;mso-fareast-language:ZH-TW">伊芒</span><b><span style="font-size:8.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">·</span></b><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D">瑞扎扎德<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><i><span style="font-size:8.0pt;color:#1F497D">-- The information contained in this message is intended only for the recipient, and may be a confidential communication or may otherwise be privileged and confidential and protected from disclosure.
 If the reader of this message is not the intended recipient, or an employee or agent responsible for delivering this message to the intended recipient, any dissemination or copying of this communication is strictly prohibited. If you have received this communication
 in error, please immediately notify us by replying to the message and then deleting it from your computer.
</span></i><i><span style="font-size:8.0pt;color:#1F497D"><o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:8.0pt;font-family:"MS Mincho";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"></span><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">
<a href="mailto:eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu">eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu</a> [<a href="mailto:eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu">mailto:eeglablist-bounces@sccn.ucsd.edu</a>]
<b>On Behalf Of </b>Johannes Bathelt<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, July 24, 2013 3:08 AM<br>
<b>To:</b> <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a><br>
<b>Subject:</b> [Eeglablist] Microstate Analysis<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Dear List,<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">I would like to compare EEG microstate analysis with some other methods. Does anyone know if there is an implementation in EEGLAB/Matlab based on 'atomize and agglomerate hierarchical clustering'?
<a href="https://sites.google.com/site/fbmlab/cartool">https://sites.google.com/site/fbmlab/cartool</a> Thank you for your help!<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Yours<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Joe<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">__________________________________________________________<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">Joe Bathelt, MSc<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><i><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">Ph.D. candidate</span></i><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:8.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">Contact Information</span></b><span style="font-size:8.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">T:</span></b><span class="apple-converted-space"><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"> </span></span><span class="apple-tab-span"><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">          
</span></span><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">+44 (0) 20 7905 2749<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">E</span></b><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">:<span class="apple-tab-span">           
</span></span><u><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:#0042AA"><a href="mailto:johannes.bathelt.10@ucl.ac.uk">johannes.bathelt.10@ucl.ac.uk</a></span></u><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">A:    </span></b><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">Developmental Cognitive Neuroscience Unit<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span class="apple-tab-span"><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">              
</span></span><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">UCL Institute of Child Health<br>
 <span class="apple-tab-span">              </span>30 Guilford Street<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span class="apple-tab-span"><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">              
</span></span><span style="font-size:7.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black">London WC1N 1EH <o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><a href="http://www.gosh.nhs.uk/medical-conditions/clinical-specialties/neurodisability-information-for-parents-and-visitors/clinics-and-services/developmental-vision-clinic/"><br>
Great Ormond Street Hospital - Developmental Vision Service</a><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><a href="https://www.ucl.ac.uk/cdcn/ourresearch/projects/socio-cognitiveskillsrecruitment">Centre for Developmental Cognitive Neuroscience </a><o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:13.5pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</body>
</html>