<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Hy there,</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">I tried to remove components from EEG data set for better results, but I cannot use the 3D brain movie in SIFT after that,because it gives an error "Index exceeds matrix dimensions".</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Basically it was a 61 channel recording with 60 (or 61) components, but I had a data set that was already pruned, it had only 16 components/dipoles. Some of the dipoles from the 16 were not in the cortex, they were deep inside the brain (eg. thalamus), so I decided to remove those in order to have better results later. After removing these components, if i check the plotting in the EEGlab, or the  EEG <1x1 struct> in MATLAB, it all says that it has 9 components left.</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">At the same time, if I try to run SIFT, every tool thinks that i have 16 components (and not 9). Even in pre-processing, the default "components to keep" goes like: 1; 2; 3; 4; 5; 6; 7; 8; 9; 10; 11; 12; 13; 14; 15; 16;</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Meanwhile it doesn't give error during the pre-pocessing or the model fitting, and the validation also seems ok. I can visualize the connectivity result in a Time-Frequency grid (and it only plots 9 x 9 figure), but when I try to visualize in BrainMovie3D, it crashes, error messages, and so on.<br>
<br>What should I do, or what did I do wrong?<br><br>Thanks,<br>Balazs</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2013/8/6 boglyas <span dir="ltr"><<a href="mailto:kamanbalazs@gmail.com" target="_blank">kamanbalazs@gmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Hy there,</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">I tried to remove components from EEG data set for better results, but I cannot use the 3D brain movie in SIFT after that,because it gives an error "Index exceeds matrix dimensions".</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">

<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Basically it was a 61 channel recording with 60 (or 61) components, but I had a data set that was already pruned, it had only 16 components/dipoles. Some of the dipoles from the 16 were not in the cortex, they were deep inside the brain (eg. thalamus), so I decided to remove those in order to have better results later. After removing these components, if i check the plotting in the EEGlab, or the  EEG <1x1 struct> in MATLAB, it all says that it has 9 components left.</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">

<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">At the same time, if I try to run SIFT, every tool thinks that i have 16 components (and not 9). Even in pre-processing, the default "components to keep" goes like: 1; 2; 3; 4; 5; 6; 7; 8; 9; 10; 11; 12; 13; 14; 15; 16;</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">

<br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Meanwhile it doesn't give error during the pre-pocessing or the model fitting, and the validation also seems ok. I can visualize the connectivity result in a Time-Frequency grid (and it only plots 9 x 9 figure), but when I try to visualize in BrainMovie3D, it crashes, error messages, and so on.<br>

<br>What should I do, or what did I do wrong?<br><br>Thanks,<br>Balazs</div></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>