<div dir="ltr"><div><div><div>Hi Octavian,<br><br></div>You can skip the inhomogeneity test, it wouldn't effect the segmentation steps. <br><br></div>Best,<br></div>Zeynep.<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">
On Wed, Jan 8, 2014 at 11:24 AM, Octavian Lie <span dir="ltr"><<a href="mailto:octavian.lie@gmail.com" target="_blank">octavian.lie@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
 Dear All,<br>
<br>
I am new to NFT. I downloaded the latest version on my 16 gb Win7<br>
laptop with matlab 13b, Optimization box v6.4.<br>
<br>
After loading a volume in the image segmentation GUI,  and clicking on<br>
Check inhomogeneity, I get the following error;<br>
<br>
<br>
Error using optimset (line 215)<br>
Unrecognized parameter name 'NonlEqnAlgorithm'.  Please see the<br>
optimset reference page in the documentation for a list of<br>
acceptable option parameters. Link to reference page.<br>
Error in segm_inhomogeneity_correction>BiasCorrLEMSS2D (line 768)<br>
                option = optimset('TolX',1e0,'Display','off',...<br>
Error in segm_inhomogeneity_correction (line 54)<br>
B = BiasCorrLEMSS2D(If, Imask.*ImaskClean, bck_mean, bck_std, options, data_B0);<br>
Error in Segmentation>pbinhomog_Callback (line 1168)<br>
[B, B0, Ic, ImaskClean] = segm_inhomogeneity_correction(I0);<br>
Error in gui_mainfcn (line 75)<br>
        feval(varargin{:});<br>
Error in Segmentation (line 61)<br>
    gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});<br>
Error in @(hObject,eventdata)Segmentation('pbinhomog_Callback',hObject,eventdata,guidata(hObject))<br>
<br>
Error while evaluating uicontrol Callback<br>
<br>
<br>
It looks that NFT uses an earlier optimset version not compatible with<br>
v6.4 toolbox. Proceeding with segmentation, all seems to work OK with<br>
no errors, but I do not know how the initial error affects the whole<br>
pipeline.<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote></div><br></div>