<div dir="ltr"><div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif">Dear Andres,</font></div><div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif">Something like this (not tested)</font></div>

<div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif"><br></font></div><div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif">cd </font><span style="color:rgb(114,50,173);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">C:\\</span><span style="color:rgb(114,50,173);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">Users\\137912\\Desktop\\</span><span style="color:rgb(114,50,173);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">Analisis\\Andres % move to this folder; </span><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">collect all 7 setfiles under this folder</span></div>

<div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif"><br></span></div><div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">topoDataVector = zeros(EEG.nbchan,7) % reserve the space</span></div><div>

<span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">allSetFiles = dir('*.set');</span><br></div><div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif">for subj = 1:length(allSetFiles)</font></div><div><font face="Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif">loadName = allSetFiles(subj).name;</font></div>

<div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">tmpEEG = pop_loadset(</span><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;color:rgb(114,50,173)">'filename'</span><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">,<font color="#7232ad"> loadName', 'filepath', pwd</font></span><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">);</span></div>

<div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">topoDataVector(:,subj) = mean(mean(tmpEEG.data(:,410:440,:),3),2); % don't forget to convert milliseconds to frames</span></div><div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">end</span></div>

<div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif"><br></span></div><div><span style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">figure</span></div><div>topoplot(mean(topoDataVector,2), EEG.chanlocs);<br>

</div><div><br></div><div>There are options for topoplot() so type 'help topoplot' to choose appropriate options for your needs. Good luck.</div><div><br></div><div>Makoto</div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">

2014-04-03 12:16 GMT-07:00 Andres Munguia Barcenas <span dir="ltr"><<a href="mailto:andres.munguiabs@udlap.mx" target="_blank">andres.munguiabs@udlap.mx</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">






<div>
<div style="font-size:12pt;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
Hi,<br>
<br>
This is what I use to get the topography which shows the average of the activity in a window of 410 to 440 ms post stimulus in one subject.
<br>
<br>
<br>
[ALLEEG EEG CURRENTSET ALLCOM] = eeglab;<br>
<p><br>
</p>
<p>EEG = pop_loadset(<span style="color:rgb(114,50,173)">'filename'</span>,<span style="color:rgb(114,50,173)">'29_CondCong.set'</span>,<span style="color:rgb(114,50,173)">'filepath'</span>,<span style="color:rgb(114,50,173)">'C:\\Users\\137912\\Desktop\\Analisis\\A1\\'</span>);<br>


</p>
<p><br>
</p>
<p>[ALLEEG, EEG, CURRENTSET] = eeg_store( ALLEEG, EEG, 0 );<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>EEG = eeg_checkset( EEG );<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>figure;pop_topoplot(<span style="color:rgb(114,50,173)"><span style="color:rgb(0,0,0)">EEG,1, 410:440,</span>'EGI file epochs pruned with ICA'</span>,[1 1] ,0,<span style="color:rgb(114,50,173)">'electrodes'</span>,<span style="color:rgb(114,50,173)">'off'</span>);<br>


</p>
<p><br>
</p>
eeglab redraw;<br>
<br>
<br>
What must I do to get the topography of a group of 7 subjects?<br>
<p><br>
</p>
<div style="color:rgb(40,40,40)">
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>De:</b> Makoto Miyakoshi <<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>><br>
<b>Enviado:</b> martes, 1 de abril de 2014 08:55 p. m.<br>
<b>Para:</b> Andres Munguia Barcenas<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a><br>
<b>Asunto:</b> Re: [Eeglablist] Topography</font>
<div> </div>
</div><div><div class="h5">
<div>
<div dir="ltr">Dear Andres,
<div><br>
</div>
<div>Type 'help topoplot' in the command line.</div>
<div>It says:</div>
<div><br>
</div>
<div>topoplot(datavector, EEG.chanlocs)<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>This is pretty simple. Here, datavector should be a column matrix such that</div>
<div><br>
</div>
<div>datavector = mean(mean(sevenSubjectsEEG(:,410:440,:),2),3);</div>
<div><br>
</div>
<div>where sevenSubjectsEEG is each subject's averaged channel x latency stuck in the third dimension, like [channels, latency, subjects], and unit for latency should be in frame and not millisecond (unless your sampling rate is 1000Hz).</div>


<div><br>
</div>
<div>If you need more explanation let us know.</div>
<div><br>
</div>
<div>Makoto</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<br>
<div class="gmail_quote">2014-03-31 12:07 GMT-07:00 Andres Munguia Barcenas <span dir="ltr">
<<a href="mailto:andres.munguiabs@udlap.mx" target="_blank">andres.munguiabs@udlap.mx</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div>
<div style="font-size:12pt;font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif">
<p>Hi,</p>
<p><br>
</p>
<p>I was running an experiment with a group 7 subjects. In the analysis, I want to get a topography which shows the average of the group (right now I can get a topography of each subject). Ideally, I would like to see the average of the activity in a window
 of 410 to 440 ms post stimulus.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>How can I get that topography? <br>
</p>
</div>
</div>
<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div>


</div></div></div>