<div dir="ltr">Dear EEGLAB, <div><br></div><div>Thanks to Tyler, Mokoto and David for your suggestions and providing your references. Your help is indeed appreciated. </div><div><br></div><div>All the best, </div><div>Ayda</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 16, 2014 at 2:16 PM, David Groppe <span dir="ltr"><<a href="mailto:david.m.groppe@gmail.com" target="_blank">david.m.groppe@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Hi Ayda,<br></div>   To add a bit to Makoto's great response, the disadvantage of having so few channels is that it impairs ICA's ability to cleanly separate sources. However, there are some nice simulation studies showing that when there are more EEG/iEEG sources than electrodes, ICA can still accurately unmix strong sources:<br><br>Makeig, S., Jung, T.-P., Ghahremani, D., & Sejnowski, T. J. (2000). Independent component analysis of simulated ERP data. In T. Nakada (Ed.), Integrated Human Brain Science (pp. 123-146). New York: Elsevier.<br><br>Kobayashi, K., James, C. J., Nakahori, T., Akiyama, T., &<br>Gotman, J. (1999). Isolation of epileptiform discharges from unaveraged EEG by independent component analysis. Clinical Neurophysiology, 110(10), 1755-1763.<br><br></div>So even with such few channels you may be able to get some accurate ICs.<br><br>The advantage (in a way) of having so few channels is that you won't need much data for ICA to provide stable results:<br><br><span style="font-family:"Times New Roman"">Groppe, D.M., Makeig, S., &
     Kutas, M. (2009) <i>Identifying
     reliable independent components via split-half comparisons</i>. <b>NeuroImage</b><span style="color:black">,
     45 pp. 1199-1211.<br><br></span></span></div><div><span style="font-family:"Times New Roman""><span style="color:black">I say "in a way" as when you have a lot of channels you can always approximate them with a lower number of principal components if need be. More data is generally always better.<br></span></span></div><span style="font-family:"Times New Roman""><span style="color:black">  Hope this helps,<br></span></span></div><span style="font-family:"Times New Roman""><span style="color:black">     -David<br></span></span><div><div><span style="font-family:"Times New Roman""><span style="color:black"><br></span></span><br><div><br><div><div class="gmail_extra"><div><div class="h5"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 16, 2014 at 1:27 PM, Makoto Miyakoshi <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Ayda,<div><br></div><div>Very interesting and promising application!<br><div><br></div><div><span><div>> 1- Are ICA results still valid to apply in this situation?</div><div><br></div></span><div>As long as they were recorded simultaneously with the same clock same subject same sampling, yes.</div><span><div><br></div><div>> 2- A total of 12 channels and large samples are enough to do the ICA? I have looked into the literature, but I cannot find a consistent validated report on the ICA on small channels. </div></span></div><div><br></div><div>I published 16ch ERP studies with ICA but only for cleaning purpose. It's fine, nothing is wrong with it.</div><div><br></div><div>Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><div><div>On Mon, Sep 15, 2014 at 9:39 PM, Ayda Ghahremani <span dir="ltr"><<a href="mailto:ghahremani.aida@gmail.com" target="_blank">ghahremani.aida@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr">Dear EEGLAB, <div><br></div><div>I have a question regarding the application of ICA to combined EEGs from scalp and LFPs from subcortical regions. </div><div><br></div><div>1- Are ICA results still valid to apply in this situation?</div><div>2- A total of 12 channels and large samples are enough to do the ICA? I have looked into the literature, but I cannot find a consistent validated report on the ICA on small channels. </div><div><br></div><div>I appreciate your help on this,</div><div>Ayda</div><div><br></div><div>PhD Candidate, </div><div>Toronto Western Hospital</div></div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><span><font color="#888888"><br></font></span></blockquote></div><span><font color="#888888"><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div>
</font></span></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br></div></div><div dir="ltr">David Groppe, Ph.D.<br>Institute Scientist<br>Laboratory for Multimodal Human Brain Mapping<br>Feinstein Institute for Medical Research <br>Manhasset, New York<br><a href="http://www.cogsci.ucsd.edu/~dgroppe/" target="_blank">http://www.cogsci.ucsd.edu/~dgroppe/</a></div>
</div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div><br></div>