<div dir="ltr">Dear Joshua,<div><br></div><div>If you want to contact Tim, send email directly to him.</div><div><br></div><div><span style="color:black;font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt">> Firstly, I would wish to ask if there has been any progress on the group-analysis module for SIFT?</span><br></div><div><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">I've heard there was a progress. Tim said he wants someone (me) to test it, but I haven't heard from him since then.</span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"><br></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">> Secondly, is it possible to use the centroid components of each cluster as the measures for SIFT?<u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">No, that does not make sense at all. Multivariate Granger Causality should be computed on single-trial data.</span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"><br></span></p><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">> Thirdly, in your opinion, would any of the possible solutions suggested above be a suitable option for group level analysis with SIFT?</span></p><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Unfortunately no.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Doesn't SIFT now has some kind of group-level analysis already? I thought Tim implemented a connection to Nima's measure (or network) projection. Check SIFT and Measure Projection.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 10, 2014 at 6:11 AM, Baker, Joshua <span dir="ltr"><<a href="mailto:joshua.baker@ntu.ac.uk" target="_blank">joshua.baker@ntu.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-GB" link="blue" vlink="purple">
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Dear Tim/All<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">I am currently wanting to use SIFT on a study with a large number of subjects. I understand that there is not currently a facility for group level analysis in
 the latest release of SIFT and I am therefore exploring methods in order to analyse multi-subject source information flow. My colleagues and I have been thinking of different ways that we could use SIFT and with what measures. Firstly we thought of using the
 centroid components of each cluster. Would the computed centroid components be accessible for use in SIFT? I appreciate the missing variable issue here in that we may have differing number of contributing components to each computed centroid component. Our
 second thought was to simply choose a representative component from each cluster (a component that is present in all/most of the subjects). Although this option is not ideal, it may be viable given it would require no further computation/scripting. A third
 option could be to z-transform all connectivity estimates for all pairs of (selected) components for all subjects and then calculate averages across our subjects.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Firstly, I would wish to ask if there has been any progress on the group-analysis module for SIFT?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Secondly, is it possible to use the centroid components of each cluster as the measures for SIFT?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Thirdly, in your opinion, would any of the possible solutions suggested above be a suitable option for group level analysis with SIFT?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Many thanks for your time and consideration,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Kindest regards,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">--<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Joshua Baker. MSc.<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Psychology Technician<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Psychophysiology Laboratory<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Division of Psychology<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Nottingham Trent University<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Email:<a href="mailto:mJoshua.baker@ntu.ac.uk" target="_blank"><span style="color:purple">Joshua.baker@ntu.ac.uk</span></a><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:black"> <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
DISCLAIMER: This email is intended solely for the addressee. It may contain private and confidential information. If you are not the intended addressee, please take no action based on it nor show a copy to anyone. In this case, please reply to this email to
 highlight the error. Opinions and information in this email that do not relate to the official business of Nottingham Trent University shall be understood as neither given nor endorsed by the University. Nottingham Trent University has taken steps to ensure
 that this email and any attachments are virus-free, but we do advise that the recipient should check that the email and its attachments are actually virus free. This is in keeping with good computing practice.
</div>

<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div></div>