<div dir="ltr">Hmm... is that because you are using 'NormalizeData'? To test this, why don't you make comparison with and without it? The low end does look attenuated, which makes sense.<div><br></div><div>By the way uncheck 'use single precision...' option when you use SIFT.<br><div><br></div><div>Makoto  </div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 4, 2014 at 9:00 PM, Tyler Grummett <span dir="ltr"><<a href="mailto:tyler.grummett@flinders.edu.au" target="_blank">tyler.grummett@flinders.edu.au</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)">Hello Makoto,</span></div><span class="">
<p></p>
<span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)">
<div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)"><br>
</span></div>
> I've never tried it, so I don't know. However, as long as EEG.CAT.srcdata has the same size as EEG.data, yes I would take it.</span><br>
</span><div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)"><br>
I transferred the data but the spectra doesnt look right.</span></div>
<div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)"><br>
</span></div>
<div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)">Is it meant to reduce the energy that much? I would have thought it would only effect the low frequencies</span></div><span class="">
<div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)"><br>
</span></div>
<div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px;background-color:rgb(255,255,255)">Tyler​</span></div>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div>
<div name="divtagdefaultwrapper">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-size:13px">*************************
<div style="font-family:Tahoma"><br>
</div>
<div><font face="Arial"><i>Tyler Grummett ( BBSc, BSc(Hons I))</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>PhD Candidate</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Brain Signals Laboratory</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Flinders University</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Rm 5A301</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Ext 66125</i></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</span><div style="color:rgb(33,33,33)">
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Makoto Miyakoshi <<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>><br>
<b>Sent:</b> Friday, 5 December 2014 2:41 PM<br>
<b>To:</b> Tyler Grummett<div><div class="h5"><br>
<b>Subject:</b> Re: [Eeglablist] detrending with SIFT</div></div></font>
<div> </div>
</div><div><div class="h5">
<div>
<div dir="ltr">I've never tried it, so I don't know. However, as long as EEG.CAT.srcdata has the same size as EEG.data, yes I would take it.
<div><br>
<div>
<div>Makoto<br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Dec 4, 2014 at 8:04 PM, Tyler Grummett <span dir="ltr">
<<a href="mailto:tyler.grummett@flinders.edu.au" target="_blank">tyler.grummett@flinders.edu.au</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">
<p>​Hey Makoto,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Is there a necessary step after that? If you just wanted to detrend your data.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>ie EEG.data = EEG.CAT.srcdata;<br>
</p>
<span>
<p><br>
</p>
<p>Tyler<br>
</p>
<p><br>
</p>
<div>
<div name="divtagdefaultwrapper">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-size:13px">*************************
<div style="font-family:Tahoma"><br>
</div>
<div><font face="Arial"><i>Tyler Grummett ( BBSc, BSc(Hons I))</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>PhD Candidate</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Brain Signals Laboratory</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Flinders University</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Rm 5A301</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Ext 66125</i></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</span>
<div style="color:rgb(33,33,33)">
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Makoto Miyakoshi <<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>><br>
<b>Sent:</b> Friday, 5 December 2014 1:05 PM<br>
<b>To:</b> Tyler Grummett<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [Eeglablist] detrending with SIFT</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div dir="ltr">Dear Tyler,
<div><br>
</div>
> I went through the code and it appears as though it is storing the data in <a href="http://EEG.CAT" target="_blank">
EEG.CAT</a>.
<div><br>
</div>
<div>Yes, that sounds right. I don't think SIFT changes EEG.data.</div>
<div><br>
</div>
<div>Makoto<br>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Dec 4, 2014 at 5:06 AM, Tyler Grummett <span dir="ltr">
<<a href="mailto:tyler.grummett@flinders.edu.au" target="_blank">tyler.grummett@flinders.edu.au</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">
<p>Hello eeglabers,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>I have a question about detrending in SIFT.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>I run the following code:<br>
</p>
<p><br>
</p>
<div>EEG = pop_pre_prepData( EEG, 'nogui', ...</div>
<div>                'VerbosityLevel', 2,   ...</div>
<div>                'SignalType', { 'Channels'},  ...</div>
<div>                'Detrend',  ...</div>
<div>                { 'verb', 2 ...</div>
<div>                'method', {'linear'}, ...</div>
<div>                'piecewise', ...</div>
<div>                {'seglength', 0.33,   ...</div>
<div>                'stepsize', 0.0825}, ...</div>
<div>                'plot', strcmp( plot, 'on')},  ...</div>
<div>                'NormalizeData', ...</div>
<div>                {'verb', 2 ...</div>
<div>                'method', {'time' 'ensemble'}}, ...</div>
<div>                'resetConfigs',true);​<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>It works fine, but I do an is equal on the data before and after and they are identical.<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Im thinking this cant be correct because it should be removing a significant proportion of my data.<br>
</div>
<div>I went through the code and it appears as though it is storing the data in <a href="http://EEG.CAT" target="_blank">
EEG.CAT</a>. Have I missed<br>
</div>
<div>something or am I doing it correctly?<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Kind regards,<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Tyler<br>
</div>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div>
<div name="divtagdefaultwrapper">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-family:Tahoma;font-size:13px">
<div style="font-size:13px">*************************
<div style="font-family:Tahoma"><br>
</div>
<div><font face="Arial"><i>Tyler Grummett ( BBSc, BSc(Hons I))</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>PhD Candidate</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Brain Signals Laboratory</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Flinders University</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Rm 5A301</i></font></div>
<div><font face="Arial"><i>Ext 66125</i></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div>
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div>
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div>