<div dir="ltr">Of course Granger causality can be applied to resting EEG data. Then some people think it's completely pointless to analyze connectivity at the sensor (scalp) level. Other will say that it's anyway a useful tool to detect changes in states, provided that you are careful with the speculations of what could possibly happen inside the brain.<div><br></div><div>With resting state recordings it's more difficult to do an efficient source reconstruction, although it can be done.</div><div><br></div><div>Another thing is that EEG signal is pretty nonlinear, and the standard formulation of GC is limited to the linear case.</div><div>I have developed a tool to detect nonlinear Granger causal interactions, you can find the code here</div><div><a href="http://users.ugent.be/~dmarinaz/KGC.html">http://users.ugent.be/~dmarinaz/KGC.html</a><br></div><div><br></div><div>Or you can consider another tool such as Transfer Entropy</div><div><a href="http://users.ugent.be/~dmarinaz/MuTE.html">http://users.ugent.be/~dmarinaz/MuTE.html</a><br></div><div><a href="http://www.trentool.de/">http://www.trentool.de/</a></div><div><br></div><div>For measures in the frequency domain (such as PDC, DTF) you can take a look at this toolbox</div><div><a href="http://www.science.unitn.it/~nollo/research/sigpro/eMVAR.html">http://www.science.unitn.it/~nollo/research/sigpro/eMVAR.html</a><br></div><div><br></div><div>or Granger Causality in the frequency domain</div><div><a href="http://www.sussex.ac.uk/sackler/mvgc/">http://www.sussex.ac.uk/sackler/mvgc/</a><br></div><div><br></div><div>But keep in mind that these measures are linear, while EEG signals are not.</div><div><br></div><div>or Phase Slope Index</div><div><a href="http://doc.ml.tu-berlin.de/causality/">http://doc.ml.tu-berlin.de/causality/</a><br></div><div><br></div><div>best regards</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Feb 5, 2015 at 11:51 AM, Eric HG <span dir="ltr"><<a href="mailto:erichg2013@gmail.com" target="_blank">erichg2013@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi everybody,<div><br></div><div>Does anyone know whether Granger causality is widely used for resting state EEG data? Or do people use partial directed coherence instead?</div><div><br></div><div>And is there any toolbox with codes for these types of analysis?</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div><br></div><div>Eric</div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>