<div dir="ltr">Hello Neha,<div><br></div><div>I'm not sure about pop_topoplot, but topoplot() takes a 1-dimensional vector (i.e., a 64x1 array, if you have 64 channels), so you can't plot all 30 trials in a single plot this way. You could make a topoplot of a single trial's standard deviation:</div><div><br></div><div>topoplot( EEG.data(:,1), EEG.chanlocs, other options... )</div><div><br></div><div>or you could instead change your data to a 64x1 matrix representing the standard deviations across all trials (instead of a 64x30 matrix with standard deviation for each trial) and plot that.</div><div><br></div><div>Others on the list might have some other solutions, but those are the ones I'm aware of.</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Steve</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><br><br></div>Stephen Politzer-Ahles<br>New York University, Abu Dhabi<br>Neuroscience of Language Lab<br><a href="http://www.nyu.edu/projects/politzer-ahles/" target="_blank">http://www.nyu.edu/projects/politzer-ahles/</a><br></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 23, 2015 at 7:29 AM, Neha Tadimeti <span dir="ltr"><<a href="mailto:nehatadimeti@gmail.com" target="_blank">nehatadimeti@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:rgb(0,0,0)"><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px">Hello,</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px">Thank you very much for the reply.</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px">My data has the dimensions (64 X 30), where 64 corresponds to the number of electrodes and 30 corresponds to the standard deviations corresponding to 30 trials. I have 7 sets of such (64 X 30) matrices. I wish to have a scalp plot of these seven blocks and compare the changes in the spread.</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px">I tried <i>pop_topoplot(EEG,0, [1:64],[8 8],'stdvalues' ,0,'electrodes','on'); </i>I am pretty sure I have not defined the parameters correctly. I would be greatly elated if you could help me rectify.</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px">Thank you.</div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div class="gmail_default" style="font-size:12.8000001907349px"><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><div><div class="h5"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Feb 22, 2015 at 10:11 PM, Stephen Politzer-Ahles <span dir="ltr"><<a href="mailto:spa268@nyu.edu" target="_blank">spa268@nyu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello Neha, <div><br></div><div>This should be possible. topoplot() takes a vector of values (typically amplitudes, or mean amplitudes over a time window) for each channel, so it should work the same if you just put in the standard deviations instead.</div><div><br></div><div>What "does not work" about what you tried? What was your code, what error did you get, etc.?</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Steve</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div><div dir="ltr"><div><br><br></div>Stephen Politzer-Ahles<br>New York University, Abu Dhabi<br>Neuroscience of Language Lab<br><a href="http://www.nyu.edu/projects/politzer-ahles/" target="_blank">http://www.nyu.edu/projects/politzer-ahles/</a><br></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote"><div><div>On Sun, Feb 22, 2015 at 6:21 PM, Neha Tadimeti <span dir="ltr"><<a href="mailto:nehatadimeti@gmail.com" target="_blank">nehatadimeti@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Hello,</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">I am a graduate student at Rutgers University. I am currently doing a research on EEG - BCI data. </div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">I have calculated the mean and standard deviation of the distribution for each electrode data for each trial. Now I wish to visualize how the spread (Standard deviation) is changing across trials at each electrode on the brain. I basically want to color code the brain with standard deviation as its parameter.</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">I tried using topoplot() function as a command line by giving my parameters as input instead of ICA data. It does not work that way.</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Can anybody suggest if EEGLAB can help me plot 2-D or 3-D images of non-ICA data. If not, I would really appreciate if any alternative methods are suggested. </div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Thank you.</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Regards,</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Neha Tadimeti.  </div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div><div dir="ltr"><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><br><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif";color:rgb(102,51,255)"></span></p><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="color:rgb(76,17,48)"><br></span><span></span></p></div></div>
</div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div></div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">-- <br><div><div dir="ltr"><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif"">T.Neha,</span></p>




<p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif"">B.Tech ECE (2010-14), </span></p>

<p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif"">Amrita University,</span></p>

<p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif"">Kerala.</span></p><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><br><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif";color:rgb(102,51,255)"></span></p><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="color:rgb(76,17,48)"><br></span><span></span></p></div></div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br></div>