<div dir="ltr">Hi Neha,<div><br></div><div>It seems like you want SD across trials for each electrode, but if I misinterpreted that, let me know. Basically, you can use topoplot to plot any values as long as you have channel locations and some data vector that is posing as EEG data. So something like this would work.</div><div><br></div><div>% your array of SD values</div><div>SD=std(EEG.data,1,3);<br></div><div><br></div><div>% Say you want to plot at 100ms. Convert ms to time point (see pop_topoplot).</div><div>TimePt=round((100/1000-EEG.xmin)/(EEG.xmax-EEG.xmin) * (EEG.pnts-1))+1;<br></div><div><br></div><div>% change colormap limits to whatever you want (MinVal MaxVal)<br></div><div>figure; topoplot(SD(:,TimePt),'Your_Channel_Locations_File', 'shading', 'interp', 'maplimits', [MinVal MaxVal]);<br></div><div>colorbar</div><div><br></div><div>If you want more of a grid style figure so you can see the SD values across trials for every latency you could do</div><div><div>figure; imagesc(SD)</div><div>set(gca,'YDir','normal')</div></div><div><br></div><div>Also type help surf if you want 3D grid style figures.</div><div><br></div><div>Sincerely,</div><div>Allan</div><div><br></div><div><br></div><div class="gmail_extra"><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div style="text-align:left"><font face="verdana, sans-serif"><span style="font-size:small"><b><font color="#ff0000"><br></font></b></span></font></div><div style="text-align:left"><font face="verdana, sans-serif"><span style="font-size:small"><b><font color="#ff0000"><br></font></b></span></font></div><div><font face="verdana, sans-serif"><span style="font-size:small"><b><font color="#ff0000">Allan Campopiano</font></b></span><span style="font-size:small"> </span><font color="#000000" style="font-size:small">| </font></font><font color="#000000" face="verdana, sans-serif">Electrophysiology Technician-Analyst</font></div><div style="text-align:left"><font color="#000000" face="verdana, sans-serif"><span style="font-size:small">Laboratory of </span><span style="font-size:small">Cognitive and Affective Neuroscience</span></font></div><div><div style="text-align:left"><font size="1" face="verdana, sans-serif"><font color="#666666">Brock University | Psychology Department | </font><font color="#666666">500 Glenridge Ave.</font><font color="#666666"><br></font></font></div><div><div style="text-align:left"><span style="color:rgb(102,102,102);font-size:x-small"><font face="verdana, sans-serif">St. Catharines, ON Canada L2S 3A1</font></span></div><div style="text-align:left"><font face="verdana, sans-serif"><font><b style="font-size:small"><font color="#ff0000">T</font></b><font color="#666666" style="font-size:small"> </font><font style="font-size:small" color="#666666">905-688-5550 x3451</font><font color="#666666" style="font-size:small"> </font><b style="font-size:small"><font color="#ff0000">F </font></b></font><span style="line-height:20px;text-align:left"><font color="#666666">905-688-6922</font></span></font></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Sun, Feb 22, 2015 at 9:21 AM, Neha Tadimeti <span dir="ltr"><<a href="mailto:nehatadimeti@gmail.com" target="_blank">nehatadimeti@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Hello,</div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">I am a graduate student at Rutgers University. I am currently doing a research on EEG - BCI data. </div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">I have calculated the mean and standard deviation of the distribution for each electrode data for each trial. Now I wish to visualize how the spread (Standard deviation) is changing across trials at each electrode on the brain. I basically want to color code the brain with standard deviation as its parameter.</div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">I tried using topoplot() function as a command line by giving my parameters as input instead of ICA data. It does not work that way.</div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Can anybody suggest if EEGLAB can help me plot 2-D or 3-D images of non-ICA data. If not, I would really appreciate if any alternative methods are suggested. </div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Thank you.</div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Regards,</div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000">Neha Tadimeti.  </div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div style="font-family:georgia,serif;color:#000000"><br></div><div><div dir="ltr"><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><br><span style="font-size:10pt;line-height:115%;font-family:"Arial","sans-serif";color:rgb(102,51,255)"></span></p><p style="margin:0in 0in 0.0001pt;line-height:115%"><span style="color:rgb(76,17,48)"><br></span><span></span></p></div></div>
</div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div></div>