<div dir="ltr">Dear Mohammed,<div><br></div><div>> Is this mean that even though I do not select the same ICs, I can still compare spatial distributions of ERSP and ERP clusters?<br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">My point is that you should not handpick the ICs before running clustering or Measure Projection. Just apply an appropriate IC cleaning (using the method I suggested for example) and let clustering or Measure Projection to choose and cluster the ICs.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">If you do not select the same ICs, you cannot compare spatial distributions between ERSP and ERP domains in MPT.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">I hope I made myself clear... sorry if my explanation is not straightforward.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, May 16, 2015 at 3:27 AM, Mohammed Jarjees <span dir="ltr"><<a href="mailto:m.jarjees.1@research.gla.ac.uk" target="_blank">m.jarjees.1@research.gla.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Dear Makoto,<br>
<br>
Thank you very much for your answer.<br>
Is this mean that even though I do not select the same ICs, I can still compare spatial distributions of ERSP and ERP clusters?<br>
<br>
Best Regards<br>
<br>
Mohammed Jarjees<br>
<br>
PhD Student<br>
Centre for Rehabilitation Engineering<br>
Biomedical Engineering Department<br>
University of Glasgow<br>
Mobile <a href="tel:%2B44%20%280%29757%20677%202323" value="+447576772323">+44 (0)757 677 2323</a><br>
<br>
________________________________________<br>
From: Makoto Miyakoshi [<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>]<br>
Sent: 15 May 2015 13:40<br>
To: Mohammed Jarjees<br>
Cc: <a href="mailto:eeglablist@sccn.ucsd.edu">eeglablist@sccn.ucsd.edu</a><br>
Subject: Re: [Eeglablist] ERSP and ERP analyse using MPT clustering method<br>
<span class=""><br>
Dear Mohammed,<br>
<br>
> 1. Should I select the same ICAs for ERP and ERSP?<br>
Follow this instruction and clean your ICs using STUDY<br>
<a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Backproject_clustered_ICs" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Backproject_clustered_ICs</a><br>
And you can use ERP or ERSP as you want in MPT. I mean you want to use the same set of ICs from this cleaning for anything.<br>
<br>
Makoto<br>
<br>
</span><span class="">On Mon, May 11, 2015 at 2:46 AM, Mohammed Jarjees <<a href="mailto:m.jarjees.1@research.gla.ac.uk">m.jarjees.1@research.gla.ac.uk</a><mailto:<a href="mailto:m.jarjees.1@research.gla.ac.uk">m.jarjees.1@research.gla.ac.uk</a>>> wrote:<br>
Dears,<br>
<br>
I want to cluster my 61 electrodes EEG data for three groups of people each group has 10 subjects and each subjects has three conditions.<br>
I would like to analyse ERSP and ERP and to use MPT clustering method. MPT suggest to use one feature at the time, so I will create separate studies for ERSP and ERP. I would like to be able to compare clustering of ERSP and of ERP as these two variables might not necessarily have the same clusters.<br>
<br>
<br>
My questions are:<br>
1. Should I select the same ICAs for ERP and ERSP?  Though this might sound a common sense, by visual inspection of ICAs I've noticed that some ICs have very strong ERP while not much is going on in ERSP and vice-versa, some have very little ERP with strong ERSP. Therefore taking common components for both might blur  results for both ERP and ERSP.<br>
2. In case I should not use the same components, may I produce two ICs sets, one filtered at 0.1Hz for ERP and the other filtered with 1Hz for ERSP. That is because filtering with 1Hz for ERSP really helps removing a baseline drift and I get clearer ICs then when filtering with 0.1 Hz (which is necessary should I analyse ERP)?<br>
Would I still be able to compare spatial locations of ERP and ERSP clusters?<br>
<br>
Thank you very much for your help.<br>
Best regards,<br>
Mohammed<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
</span>To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><mailto:<a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a>><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><mailto:<a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a>><br>
<div class=""><div class="h5"><br>
<br>
<br>
--<br>
Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>