<div dir="ltr">Dear Evan,<div><br></div><div>> I am trying to meet a deadline for my research project (next week) and I am really struggling with data analysis.</div><div><br></div><div>Sorry I read it now.</div><div><br></div><div>> My professors are completely unfamiliar with EEGLAB so my knowledge only encompasses what I could gather from tutorials.<br></div><div><br></div><div>So were my former mentors.</div><div><br></div><div>> Please let me know what I am missing/what else you think I should be doing in order to efficiently get valid data that I can start comparing and writing about. <br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">In your case, data cleaning before ICA is missing. This is a very important stage. See this page for future info. Read Nima's paper too (referenced there)</div><div class="gmail_extra"><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Makoto's_preprocessing_pipeline">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Makoto's_preprocessing_pipeline</a><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">> 7.  Spectral analysis of the epochs to then compare frontal alpha asymmetry<br>-How would I calculate a significant difference?<br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">You should use EEGLAB STUDY to run the stats on this. Check also NBT by Simon Shlomo-Poil.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jul 9, 2015 at 7:06 PM, Evan Wilson <span dir="ltr"><<a href="mailto:erw007@bucknell.edu" target="_blank">erw007@bucknell.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Dear List,<br>
<br>
I am a novice in need of some general guidance.  I am trying to meet a deadline for my research project (next week) and I am really struggling with data analysis.  My professors are completely unfamiliar with EEGLAB so my knowledge only encompasses what I could gather from tutorials.<br>
<br>
I currently have a raw .edf file (I used the Emotiv EPOC research edition).  I am trying to examine frontal alpha asymmetry at specific points in an experience and compare it across two separate conditions (one where subjects were walking around so I assume there are quite a lot of artifacts to remove).  These are the steps I know how to do so far:<br>
<br>
1. I imported the continuous data<br>
<br>
2. I added channel locations (although EEGLAB gives me trouble, saying there can’t be empty channels, but I found a way around this)<br>
<br>
3. Remove the baseline (I was told this is likely unnecessary)<br>
<br>
4. Run ICA (do I do this before or after adding high and low pass filters?)<br>
- Also, what does this do as far as filtering the data? I am still a little confused about this but I am under the impression that it is a pivotal step.<br>
<br>
5. It was suggested that I could then just filter the data down to ~7 - 14 Hz and this will filter out most artifacts and preserve the alpha bands, but this seems fishy to me.<br>
<br>
6. Epoch the data to just the three or four instances I wish to examine<br>
-I am unsure about this part.  I do not know if this is the correct next step nor do i know how to epoch the data, but I figure I can refer back to the tutorials for the latter.<br>
<br>
7.  Spectral analysis of the epochs to then compare frontal alpha asymmetry<br>
-How would I calculate a significant difference?<br>
<br>
Please let me know what I am missing/what else you think I should be doing in order to efficiently get valid data that I can start comparing and writing about.  Sorry if these are really basic questions, guys, but I am looking down the barrel right now and nobody else has been able to help me so far.<br>
<br>
All the best,<br>
<br>
Evan<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>