<div dir="ltr">Dear Elizabeth,<div><br></div><div>A projection from ICs to channels is a 'forward projection'. We've been using the word 'backprojection' in the wrong way, so I corrected it (at least in my functions).</div><div><br></div><div>In ICA, the polarity of map and time-series signal can be flipped by applying -1 to the both. This is a fundamental uncertainty.</div><div><br></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">> If I want to use this, or any other, IC to measure the amplitude / latency of particular ERP deflections it is necessary to know which is the correct channel to choose for back-projection. However, I am unsure as to how to make this decision objectively.</span><br></div><div> </div><div>I wrote pvaftopo() plugin for this purpose</div><div><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Plugin_list_process">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Plugin_list_process</a><br></div><div>pvaf is a new concept Scott proposed nearly 20 years ago which is</div><div><br></div><div>percent variance accounted for (pvaf) = 100-100*var(all_data - selected_ICs)/var(all_data)</div><div><br></div><div>We'll publish IEEE EMBC conference proceedings soon for this year about the study-level envtopo and pvaf, so you may want to refer to the paper once it's published (Lee et al., IEEE EMBC conf proc 2015)</div><div><br></div><div>Pick up the channel that is closest to the peak in the scalp maps and you can choose the 'most accounted' channel objectively.</div><div><br></div><div>I'm happy that there is finally a user asking for this plugin!</div><div><br></div><div>Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jul 31, 2015 at 2:13 PM, Elizabeth Milne <span dir="ltr"><<a href="mailto:e.milne@sheffield.ac.uk" target="_blank">e.milne@sheffield.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8000001907349px">Dear EEGLAB team,</span><div style="font-size:12.8000001907349px">I have a question about resolving the "true" polarity of IC ERPs by back-projecting to channel data. Using erpimage, I have obtained the ERP of an IC, but the polarity is different (orthogonal) when back-projecting to different channels. In another example from a different IC, the polarity of the ERP does not change, but the amplitude of the signal is different depending on which channel is selected for back-projection.</div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">If I want to use this, or any other, IC to measure the amplitude / latency of particular ERP deflections it is necessary to know which is the correct channel to choose for back-projection. However, I am unsure as to how to make this decision objectively. Are there particular features that I should look at to make this decision more systematic, i.e. dipole projection? % power accounted for?</div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">If anyone can offer advice, or point out errors in my understanding I'd be very grateful. </div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Many thanks,</div><div style="font-size:12.8000001907349px">Elizabeth</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div>Elizabeth Milne<br>Reader in Cognitive Neuroscience<br>University of Sheffield<br>Western Bank<br>Sheffield<br>S10 2TN<br> <br><a href="tel:%2B44%20%280%29%20114%20222%206558" value="+441142226558" target="_blank">+44 (0) 114 222 6558</a><br> <br><a href="http://www.autismresearchlab.group.shef.ac.uk/" target="_blank">http://www.autismresearchlab.group.shef.ac.uk/</a></div></div></div>
</font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>