<div dir="ltr"><div>Dear Makoto</div><div><br></div><div>Thanks for the advice. After advice from someone on the list I've tried loading the ICA weights onto the 0.1Hz data and then removing the artifactual components from there. It seems to work well.</div><div><br></div><div>Kind regards,</div><div><br></div><div>Neil</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 22 August 2015 at 09:43, Makoto Miyakoshi <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Neil,<div><br></div><div>I saw your code. I don't know what's wrong with it.</div><div>Maybe after copying the ICA matrices, you want to try</div><div><br></div><div>EEG = eeg_checkset(EEG, 'ica')'</div><div><br></div><div>to let EEGLAB re-calculate ICA activations etc. I'm not sure though if it will solve the problem.</div><div><br></div><div>Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><div><div class="h5">On Wed, Aug 19, 2015 at 8:29 PM, Neil Bailey <span dir="ltr"><<a href="mailto:neil.bailey@monash.edu" target="_blank">neil.bailey@monash.edu</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;padding-left:1ex;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-width:1px;border-left-style:solid"><div><div class="h5"><div dir="ltr">Hi all<div><br></div><div>I'm having trouble applying my ICA weights from 1Hz filtered data to my 0.1Hz filtered data.</div><div><br></div><div>I've been trying to use a script adapted from a previous post by Stefan Debener to take the ICA weights out of the 1Hz data and put them into the 0.1Hz data. The script is effective for transfering the ICA weights (they show up in the EEG.ica... sections of the 0.1Hz dataset), but when I plot the 0.1Hz dataset the components that I removed are still in the trace (ie. eye blinks remain in the trace). An example section of the script I'm using is listed below.</div><div><br></div><div>I'm applying the ICAs to epoched data rather than continuous data, but I can't see that that would be the problem. Am I missing a required step? Like perhaps removing the artifact components?</div><div><br></div><div>Load 1Hz filtered data set after ICA has been conducted and bad components have been removed, then:</div><div><pre style="color:rgb(0,0,0)">>><i> TMP.icawinv = EEG.icawinv;
</i>>><i> TMP.icasphere = EEG.icasphere;
</i>>><i> TMP.icaweights = EEG.icaweights;
</i>>><i> TMP.icachansind = EEG.icachansind;
</i>>><i>
</i>>><i> % apply to epoched dataset
</i>>><i> clear EEG;
</i>>><i> EEG = pop_loadset('filename', [SUBJ{s}, '_bcgrem.set'], 'filepath', PATHIN);
</i>>><i> EEG.icawinv = TMP.icawinv;
</i>>><i> EEG.icasphere = TMP.icasphere;
</i>>><i> EEG.icaweights = TMP.icaweights;
</i>>><i> EEG.icachansind = TMP.icachansind;
</i>>><i> clear TMP;
</i>>><i> EEG = pop_saveset(EEG, 'filename',[SUBJ{s}, '_epoched.set'],
</i>>><i> 'filepath',PATHOUT);
</i>>><i> [ALLEEG, EEG, CURRENTSET] = eeg_store(ALLEEG, EEG, 0);
</i>>><i>
</i>>><i> end
</i>>><i> eeglab redraw;</i></pre></div><div>Kind regards,</div><span><font color="#888888"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Neil Bailey (PhD)</div><div>Monash Alfred Psychiatry Research Centre</div><div><a href="mailto:Neil.Bailey@Monash.edu" target="_blank">Neil.Bailey@Monash.edu</a></div><div>(03) 9076 5032</div></div></div></div></div>
</font></span></div>
<br></div></div><span>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank" rel="noreferrer">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></span></blockquote></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</font></span></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>Neil Bailey (PhD)</div><div>Monash Alfred Psychiatry Research Centre</div><div><a href="mailto:Neil.Bailey@Monash.edu" target="_blank">Neil.Bailey@Monash.edu</a></div><div>(03) 9076 5032</div></div></div></div></div>
</div>