<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Hello Naveen, A few notes and recommendations for next steps below, good luck with the process! Cheers.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default"><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><font color="#333399">Residual variance is term used often in "dipole fitting" and can generally be thought of </font><span style="color:rgb(51,51,153)">as representing </span></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(51,51,153)">how well the dipole fits the ICA scalp map. Low RV is good, bad RV is high. A good cutoff is 15%. </span></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(51,51,153)"><br></span></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">See mentions of residual variance here:<br></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/A08:_DIPFIT">http://sccn.ucsd.edu/wiki/A08:_DIPFIT</a></font><br></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default"><div class="gmail_default"><font color="#333399">See Delorme et al 2012 too to learn more about ICA and dipoles:</font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><a href="http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0030135">http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0030135</a></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">Read the Onton & Makeig chapter from 2011, a preprint is here:</font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><a href="http://sccn.ucsd.edu/~scott/pdf/Makeig_Onton_LuckERP11.pdf">http://sccn.ucsd.edu/~scott/pdf/Makeig_Onton_LuckERP11.pdf</a><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">This chapter is good for learning about good and bad ICs.</font></div></div></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(51,51,153)"><br></span></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><div class="gmail_default"><font color="#333399">You can use the eeglab STUDY function to use the dipfit results for examining data </font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">across multiple subjects. Remember that in eeglab, the IC activations </font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">themselves are considered to represent the estimated activity of the dipoles.</font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">In other words, the dipole results themselves do not represent neural "activity" over time, the ICs do.</font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">Please review the items below if you have not had a chance to yet.</font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_02:_STUDY_Creation">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_02:_STUDY_Creation</a><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399"><a href="http://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_03:_Working_with_STUDY_designs">http://sccn.ucsd.edu/wiki/Chapter_03:_Working_with_STUDY_designs</a></font></div></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(51,51,153)"><br></span></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(34,34,34)"><span style="color:rgb(51,51,153)"><br></span></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">Ask google about "residual variance" and also about "dipole fitting EEG" to learn more.</font></div><div class="gmail_default"><font color="#333399">See the "source imaging or source analysis" documentation from besa, brain products, fieltrip as well.</font></div></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">also, please be sure to  practice working with ICs and dipoles with the eeglab tutorial <br></div><div class="gmail_default" style=""><div class="gmail_default"><font color="#333399">data first, so as to make sure that you understand how everything works with proper dataset.</font></div></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399">also, please be sure to download and test out  eeglab plugins such as SASICA and </font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399">MARA to pick good ICs using multiple empirical criteria. </font><span style="color:rgb(51,51,153)">Use google </span></div><div class="gmail_default" style=""><span style="color:rgb(51,51,153)">to find these plugins. You may also use the eeglab add-plugin function right from the eeglab gui.</span><br></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><br></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><br></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div><div class="gmail_default" style=""><br></div><div class="gmail_default" style=""><font color="#333399"><br></font></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 7, 2015 at 8:11 AM, Naveen Bhardwaj <span dir="ltr"><<a href="mailto:naveenno122k@gmail.com" target="_blank">naveenno122k@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all EEGLAB members,<br><br><div>I gone through DIPFIT tool ( which is good to plot source
 localization) but after plotting dipole  of the components i found 
difficulty in interpretation of components.<br>So i have some questions,<br></div><div><br></div>Q: What is residual variance and how do i interpret independent components based on  RV % ?  What RV% indicates ?<br><div>Q: What different colors of the dipole indicates in the same independent components and their directions?<br></div><div>Q:
 Is that possible to explain physiological significance of multiple 
subjects at one go using DIPFIT. cumulative study through DIPFIT<br></div><div><br><br></div>Thanks for your help<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all"><div><br>-- <br><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span><b><font face="times new roman, serif" color="#000000" size="2">With Warm Regards 
</font></b><div style="color:rgb(136,136,136)"><span style="color:rgb(102,0,0)"><span style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif"><b><br></b></span></span></div><div style="color:rgb(136,136,136)"><span style="color:rgb(102,0,0)"><span style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)"><b><br></b></span></span></div><span style="color:rgb(102,0,0)"><span style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)"><b>
</b></span></span><div><b><span style="font-family:times new roman,serif"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font size="2">Naveen Bhardwaj</font></span></span></span></b></div><div><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><b><font face="times new roman, serif">Research Scholar</font></b></span></span></div><div><font size="2"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, serif">PhD (Instrument Technology - Human Machine Interaction)</font></span></span></font></div><div><font size="2"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, serif">Instrument Design & Development Centre</font></span></span></font></div><div><font size="2"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, serif">Indian Institute of Technology, Delhi</font></span></span></font></div><div><font size="2"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, serif"><br></font></span></span></font></div><div><font size="2"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, serif">Skype Id- naveenb13</font></span></span></font></div><div><font size="2"><span style="color:rgb(102,102,102)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font face="times new roman, serif">Mobile: <a href="tel:%2B91-9717173826" value="+919717173826" target="_blank">+91-9717173826</a></font></span></span></font></div></span><span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><b><span style="color:rgb(61,133,198)"><span style="background-color:rgb(243,243,243)"></span></span></b></span><br><div><span style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><b><span style="color:rgb(61,133,198)"><span style="background-color:rgb(243,243,243)"><br></span></span></b></span></div><div><b><br></b></div>
<div><b> </b></div></div><div><font face="'comic sans ms', sans-serif" color="#ff0000"></font> </div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>