<div dir="ltr">Dear Nike,<div><br></div><div>> When we run ICA on the continuous data after artifact rejection, aren't these abrupt transitions going to affect my ICA results ?<br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">No, because ICA shuffles all the datapoints for every iteration. Are you surprised? It means that ICA does not know extension of time, it only cares inter-channel relation for each time points.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><div>> How can I extract epochs such that none of my epochs contain the the abrupt transitions ?</div><div><br></div><div>That's impossible. There are techniques such as windowing, blending, etc to reduce the abruptness, but epoching does not use them (and do not need to use them).</div><div><br></div><div>> I am guessing that I have to use the BOUNDARY marks, but am not sure how. <br></div><div><br></div><div>If you have boundary events, eeglab filter process will not go across it but uses windowing function to fade out/fade in before and after the boundary. Epoching will reject any epoch that contain boundary, etc.</div></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Sep 6, 2015 at 11:48 PM, Nike gnanateja <span dir="ltr"><<a href="mailto:nikegnanateja@gmail.com" target="_blank">nikegnanateja@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><br></div>Dear List, <br><br></div>I have recently shifted from artifact rejection of epoched data to continuous data. In the process I have noticed that artifact rejection of continuous data leads to abrupt transitions/discontinuities in the signal. wont these discontinuities affect the later stages of processing. I have a few questions on this issue<br><br></div>When we run ICA on the continuous data after artifact rejection, aren't these abrupt transitions going to affect my ICA results ?<br><br></div>How can I extract epochs such that none of my epochs contain the the  abrupt transitions ? I am guessing that I have to use the BOUNDARY marks, but am not sure how. <br><div><div><div><div><div> <div><div><br><br></div><div>regards, <br><br></div><div>Nike<span class=""><font color="#888888"><br></font></span></div><span class=""><font color="#888888"><div>-- <br><div><div dir="ltr"><div><font face="georgia,serif" color="#6633ff"><a href="http://goog_636235333" target="_blank">G Nike Gnanateja, MSc (Audiology)</a></font></div><div><font face="georgia,serif" color="#6633ff">Junior Research Fellow,</font></div><div><font face="georgia,serif" color="#6633ff">Department of Audiology, </font></div><div><font face="georgia,serif" color="#6633ff">All India Institute of Speech</font></div><div><font face="georgia,serif" color="#6633ff">and Hearing Mysore-06</font></div></div></div>
</div></font></span></div></div></div></div></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>