<div dir="ltr">Dear Adrien,<div><br></div><div>size(EEG.data,1) should absolutely match with the number of channels to import (if you have fiducials, plus 3). You can discard channel info in GUI right after importing it so that it matches size(EEG.data,1).</div><div><br></div><div>Also, do not confuse channel edit with channel selection! pop_select() will reject channels with time-series, so it's a channel rejection and your size(EEG.data,1) will be smaller after rejection.</div><div><br></div><div>Makoto</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Sep 23, 2015 at 4:13 AM, Adrien Martel <span dir="ltr"><<a href="mailto:amartel@tcd.ie" target="_blank">amartel@tcd.ie</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word"><div style="font-family:Helvetica,Arial;font-size:13px;color:rgba(0,0,0,1.0);margin:0px;line-height:auto">Hello,</div><div style="font-family:Helvetica,Arial;font-size:13px;color:rgba(0,0,0,1.0);margin:0px;line-height:auto"><br></div><div style="font-family:Helvetica,Arial;font-size:13px;color:rgba(0,0,0,1.0);margin:0px;line-height:auto">I’m trying to import raw biosemi data with the function ‘pop_biosig’ but I’d like to only import 64 channels and the 4 EOGs with P9 and P10 as linked mastoid references. Due to a bad config file for the biosemi system 234 channels were saved while only 64+6 channels were actually recording.</div><div style="font-family:Helvetica,Arial;font-size:13px;color:rgba(0,0,0,1.0);margin:0px;line-height:auto"><br></div><div style="font-family:Helvetica,Arial;font-size:13px;color:rgba(0,0,0,1.0);margin:0px;line-height:auto">When I import using the line:</div><div style="font-family:Helvetica,Arial;font-size:13px;margin:0px"><p style="color:rgb(0,0,0);margin:0px;font-size:9px;font-family:Courier">  EEG = pop_biosig(file, <span style="color:#b245f3">'channels'</span>,[1:64 227:230] ,<span style="color:#b245f3">'ref'</span>,[24 61] ,<span style="color:#b245f3">'refoptions'</span>,{<span style="color:#b245f3">'keepref'</span> <span style="color:#b245f3">'on'</span>});</p><div style="color:rgb(0,0,0)">and later edit the channel locations with:</div><div style="color:rgb(0,0,0)"><p style="margin:0px;font-size:9px;font-family:Courier;color:rgb(178,69,243)"><span style="color:#000000">EEG=pop_chanedit(EEG, </span>'load'<span style="color:#000000">,{</span>'cap64_new.loc'<span style="color:#000000"> </span>'filetype'<span style="color:#000000"> </span>'loc'<span style="color:#000000">},</span>'setref'<span style="color:#000000">,{</span>'24  61'<span style="color:#000000"> </span>'P9  P10'<span style="color:#000000">});</span></p></div><div style="color:rgb(0,0,0)"><br></div><div style="color:rgb(0,0,0)">The last line produces the warning: </div><div><div><font color="#ff9300">Warning: channel labels should not be empty, creating unique labels </font></div><div style="color:rgb(0,0,0)">Warning: the size of the channel location structure does not match with</div><div style="color:rgb(0,0,0)">         number of channels. Channel information have been removed.</div></div><div style="color:rgb(0,0,0)"><br></div><div style="color:rgb(0,0,0)">and the EEG.chanlocs structure is changed to a default template ( .labels: Ch1 , Ch2 …)</div><div style="color:rgb(0,0,0)"><br></div><div style="color:rgb(0,0,0)">I tried first importing all the channels and then use pop_select but unfortunately many of the 234 channels have the same name which either selects empty channels or deletes actually recording ones.</div><div style="color:rgb(0,0,0)"><br></div><div style="color:rgb(0,0,0)">Is there a way to import only certain channels without discrepancies between the .data and .chanlocs? </div><div style="color:rgb(0,0,0)">Or can channels be targeted by pop_select in a different way than with the name of the channels, or possibly rename the channels according to a 10-20 channel template?</div><div style="color:rgb(0,0,0)"><br></div><div style="color:rgb(0,0,0)">Any help would be much appreciated!</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div style="color:rgb(0,0,0)">Adrien Martel</div></font></span></div></div><br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div>