<div dir="ltr">Dear Shingo,<div><br></div><div>If you create STUDY using ICs, difference in the number of channels across subject does not matter. Generally speaking, I would be nervous if I need to edit channels after ICA since I've experienced some troubles. If you want to run ICA with interpolated channels, you need to estimate data rank (by running Matlab function 'rank' note that if you provide too long data it'll return very low rank!) and use option 'pca' to reduce rank. Thus I usually recommend one does not interpolate channels after rejecting bad ones.</div><div><br></div><div>> The topography seems different between before and after the re-location of the channels.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">I believe it's just interpolation algorithm returns the different coordinates than the original coordinates (which were digitized)... if that's the case it's normal.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">ps Hirokazu Tanaka who has been with us in SCCN told me that he met you in ASCON.</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 23, 2015 at 4:36 AM, Shingo Tokimoto <span dir="ltr"><<a href="mailto:tokimoto@mejiro.ac.jp" target="_blank">tokimoto@mejiro.ac.jp</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Dear EEGLAB users,<br>
<br>
I am analyzing my EEG data following Makoto's preprocessing pipeline. For some of my participants' data, I remove bad channels and interpolate them after ICA. When I present the ERP and the ERSP, a warning message appeared noticing that the channel locations were different among the participants. Therefore, I now re-locate the channels so that the numbers of the channels will be identical with that before the channel removal. The topography seems different between before and after the re-location of the channels. I am wondering whether I should re-locate the channels after the interpolation. I appreciate any comments and suggestions. Thank you in advance.<br>
<br>
************************************************<br>
Shingo Tokimoto, Ph.D.<br>
in Linguistics and Psychology<br>
Department of Foreign Languages<br>
Mejiro University<br>
4-31-1, Naka-Ochiai, Shinjuku, Tokyo,<br>
161-8539, Japan<br>
<a href="mailto:tokimoto@mejiro.ac.jp" target="_blank">tokimoto@mejiro.ac.jp</a><br>
************************************************<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>