<div dir="ltr">Dear Nikola,<div><br></div><div>Sorry I did not understand the question very well. I thought that I would compute statistics from the baseline period data and use the 1 percentile value to threshold the after-baseline period for each frequency...</div><div><br></div><div>Makoto</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, Jan 2, 2016 at 9:53 AM, Nikola Vukovic <span dir="ltr"><<a href="mailto:vukovicnikola@gmail.com" target="_blank">vukovicnikola@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Happy New Year to everyone on the list!<br>
Is it too early to start doing analyses again? :)<br>
<br>
I would like to know if there's a way to use the command line to plot a figure showing only ERSP values significantly different from a baseline. For example, I would like to define the time period from 0 to 1000ms in a trial as the baseline period, and then see which ERSP values in the 1000-8000ms period differ significantly from this baseline.<br>
<br>
So far, I have only been able to mask values significantly different from 0, like so:<br>
<br>
1. I plot a STUDY condition using std_erspplot, and save the erspdata/times/freqs output.<br>
2. I compare this erspdata object with an identically sized object with zeroed-out values, using std_stat.<br>
3. I use the pvals object to zero-out those ersp values which are > 0.05, and then plot this ersp data.<br>
<br>
This procedure works nicely to compare time-frequency points to 0, but not for masking with respect to a custom defined baseline period.<br>
<br>
Does anyone know how this could be done?<br>
<br>
Many thanks!<br>
Nikola<br>
_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div>