<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:#333399">Hello Edward, The pipeline is a good recommendation but it does not cover all possible cases. It just a rough map. One needs to use it smartly and know why one is doing each step. That being said...</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">What's recommended in that pipeline is -1 second to +2 seconds around an event at 0 time.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">If you don't have a event-related paradigm to which you're locking your epochs, and if your data is continuous,</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">then you just want to epoch your data as you wish (into 2 or 3 second chunks).</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">Note that ICA does not care if your data is epoched or not, it mixes up all time points for it's purposes.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399">Note that some people epoch continuous data in order to remove the worst periods.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">So for example, you can run something like the pop_rejcont function, which will remove big bad periods from the continuous data, and then epoch using reg_epoch, and then drop the worst epochs, and then ICA.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399">One can also skip the continuous rejection, as the bad data will be detected in some epochs anyway.</div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div><div class="gmail_default" style="color:#333399"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sun, Jan 10, 2016 at 10:59 PM, Edward Wiskers <span dir="ltr"><<a href="mailto:edwardwiskers@gmail.com" target="_blank">edwardwiskers@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div>Hi everyone, <br><br></div>I'm wondering whether this code "<span style="font-size:11pt;line-height:115%;font-family:"Calibri","sans-serif"">EEG
= eeg_regepochs (EEG, 'recurrence', 2, 'rmbase', NaN)</span>" applies the recommendation of Makoto's preprocessing pipeline (epoch length of -1 to 2 sec) or not? If not, so how to adjust it to make it suits the recommendation?<br><br></div>Thanks.<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">Edward<br><div><div><br></div></div></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>