<div dir="ltr">Dear Joseph,<div><br></div><div>> 1. What epoch lengths do I use for both blocks? Are -500ms to 3000ms, and -500 to 5000ms okay for block 1 and block 2 respectively?<br><br>No, make them equal lengths.<br><br>> 2. For time-frequency transforms, do I need to subtract the baseline from the data before I do the transformation?<br><br>Not necessary if your data is high-pass filtered properly. ERP baseline subtraction is different from ERSP baseline subtraction too.<br><br>> 3. As a follow up from question 2, do I perform ICA before the subtraction?<br><br>This does not matter, but after ICA sounds better. If you do, make sure that you use long baseline (0.5-1 sec; if short baseline as pre-ICA process, it'll compromise ICA performance by Groppe et al).<br><br>> 4. What is the effect of normalizing the data before computing the power in each channel? <br></div><div><br></div><div>Do not normalize data for spectrum analysis. You'll lose information.</div><div><br></div><div>Makoto</div><div><br></div><div><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jun 28, 2016 at 12:09 PM, Joseph Nuamah <span dir="ltr"><<a href="mailto:jknuamah@aggies.ncat.edu" target="_blank">jknuamah@aggies.ncat.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Dear Everyone,<br><br>I have a data set from an experiment that had two blocks of trials.<br><br>Each block had 30 trials. Whereas each trial in block 1 had a duration of 6000ms, each trial in block 2 had a duration of 60 000 ms. The ISI for both blocks was 3000 ms.<br><br>The sampling frequency was 256Hz. A trial ended when a participant clicked the mouse button. I found out that for both cases, participants clicked the mouse before elapse of the stipulated trial duration.<br><br>My questions are:<br><br>1. What epoch lengths do I use for both blocks? Are -500ms to 3000ms, and -500 to 5000ms okay for block 1 and block 2 respectively?<br><br>2. For time-frequency transforms, do I need to subtract the baseline from the data before I do the transformation?<br><br>3. As a follow up from question 2, do I perform ICA before the subtraction?<br><br>4. What is the effect of normalizing the data before computing the power in each channel? <br><br></div>Thanks.<span class=""><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span class=""><font color="#888888">Joseph.<br></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>