<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Hello Ruben, some notes below that may be of use. best wishes.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">*************************************</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">Regarding your epoch rejection, order seems generally correct. I would suggest also visually inspecting and making changes in thresholds if necessary, and using other sub-tools in the channel-based rejection GUI. With 128 channels, the data is well suited to ICA based artifact-detection and ICA-based analyses. If you haven't had a chance to, examine time-frequency dynamics for particular ICs. See also several tools for cleaning data that come with eeglab, including "trim outlier" and the ASR-based continuous data cleaning. </div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">One can drop the mastoid channels after rereference to them. <br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">No need to put back in the Fcz. Consider just dropping bad channels, average reference with good channels (see e.g, prep pipeline), and then interpolate bad channels.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">However, plenty of researchers "rereference" to all channels at the start of their pipelines rather than only using good channels.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">One could interpolate Fcz as a last step if one wants to report on it.</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)">If you haven't had a chance to, see Makoto's pipeline suggestions, eeglab online tutorials for time-frequency analysis and all eeglab aspects, as well google eeglab list for past mentions regarding your topics.<br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(51,51,153)"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, Jul 16, 2016 at 2:26 AM, Ruben Perellón Alfonso <span dir="ltr"><<a href="mailto:ruben.palfonso@gmail.com" target="_blank">ruben.palfonso@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello!<div><br></div><div>I am about to pre-proces data before doing Morlet Wavelet Transform.</div><div>Some trials where already rejected based on visual rejection criteria and bad channels where also identified via visual inspection..</div><div>These are the next planned steps:</div><div><br></div><div>1. Re-reference data to linked Mastoids (TP9, TP10)</div><div>2..Interpolate bad channels.</div><div>3. Reject epochs based on threshold -+500microV</div><div>4. Reject epochs based on improbable events, 6SD per channel 2SD for all channels.</div><div>5. Do wavelet transform</div><div><br></div><div>I would really appreciate the input regarding how correct the order of this steps looks to you, and whether you consider some fundamental step is missing.</div><div><br></div><div>I also have a concrete question regarding step 1: </div><div>We recorded using a 128 channels Brain Producs system, with a common reference at FCz. This reference does not appear on import of data into EEGLAB of course. Now I am wondering how to properly re-reference the data. In the EEGLAB wiki it says that for linked mastoids, one should first create a dummy channel of zeros for the common reference, then do average reference keeping the common reference, and only then re-reference again to the mastoids. But why can't I just directly re-reference to mastoids? Once re-reference is done, is there any reasons why I should keep the reference channels in the data?</div><div><br></div><div>Thanks</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>Ruben</div></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.edu</a><br></blockquote></div><br></div>