<div dir="ltr">Dear Maya,<div><br></div>> Due to different ERSP parameters gives different clustering layouts I cannot compare directly the networks of different frequency bands.<div><br></div><div>Then cluster ICs by one ERSP (or spectrum or dipole location) parameter, and compare activities across different frequency bands. We usually take that approach.</div><div><br></div><div>Makoto<br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Aug 18, 2016 at 4:36 PM, Maya Pinacle <span dir="ltr"><<a href="mailto:mayapinacle@gmail.com" target="_blank">mayapinacle@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><span class=""><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;float:none;display:inline!important;background-color:rgb(255,255,255)">Hi Makoto, </span><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)">Thank you very much for the answers. The main issue that I am having is I would like to compare the behaviours of the networks between the clusters for the different frequency bands as well. Due to different ERSP parameters gives different clustering layouts I cannot compare directly the networks of different frequency bands.</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)">If I filter the data before hand the clustering, I also doub that I might end up with different clustering layouts.  Hence in such a case, would you recommend cluster the components in a broad band ERSP and then filter the data to the frequency band of interest and run the connectivity analysis?</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)">Thank you very much in advance,  </div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)">Maya</div></span><div style="outline:none medium;padding:10px 0px;width:22px;margin:2px 0px 0px;color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;font-style:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255)"><div style="border:1px solid rgb(221,221,221);clear:both;line-height:6px;outline:none medium;width:20px;background-color:rgb(241,241,241)"><img src="https://ssl.gstatic.com/ui/v1/icons/mail/images/cleardot.gif" style="min-height: 8px; width: 20px; background: url("") 0% 0% no-repeat scroll transparent;"></div></div></div><div class=""><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2016-08-18 22:51 GMT+01:00 Makoto Miyakoshi <span dir="ltr"><<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Maya,<span><div><br></div><div>> So for a clustering on a specific frequency band should I filter each subject's data on that specific frequency band before creating the study and then to run clustering on that data?</div><div><br></div></span><div>That works.</div><span><div><br></div><div>> or Is there a way to run clustering on a specific frequency band setting the preclustering frequency parameters to the frequency band of interest? <br></div><div class="gmail_extra"><br></div></span><div class="gmail_extra">You can specify frequency range in ERSP when clustering. It should be easier for you.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">However... does ICA identify gamma? I doubt it. This is because 1) gamma has small amplitude 2) gamma does not have a broad network. When I found gamma, it was almost always coupled with theta (and it could have been just micro tremor of eyes...)</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><div><div>On Wed, Aug 17, 2016 at 1:11 PM, Maya Pinacle <span dir="ltr"><<a href="mailto:mayapinacle@gmail.com" target="_blank">mayapinacle@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr"><div>Dear All, <br><br><br></div><div>I have a Study file contain datesets from 23 subjects, and I would like to cluster the ICs in the alpha frequency band and gamma frequency band seperately. Hence this will give me the chance to compare the differences between the frequency bands' behaviours on clustering. <br><br></div><div>However I am a bit confused with the way of clustering on a specific frequency band so I would really appreciate your recomendations on that. So for a clustering on a specific frequency band should I filter each subject's data on that specific frequency band before creating the study and then to run clustering on that data? or Is there a way to run clustering on a specific frequency band setting the preclustering frequency parameters to the frequency band of interest? <br><br></div><div>I would really appreciate any comments on that please.<span><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span><font color="#888888"><div>Maya<br></div><div><br><br><br></div></font></span></div>
<br></div></div>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a><span><font color="#888888"><br></font></span></blockquote></div><span><font color="#888888"><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</font></span></div></div>
</blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div></div>