<div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>Thank you all for your answers and useful links. I have a follow-up question regarding the 1Hz filter Makoto suggests using before running ICA.<div>I would use this filter just for the ICA and then apply the weights to the unfiltered data. But I was actually wondering about the slow drifts that this filter tackles; how do such artifacts impact on time frequency analyses and/or ERP's? Can I leave them in (as I would if doing the backtransform), provided I am mainly interested in frequencies above 3 Hz? Or should I reject these trials regardless?</div></div><div><br></div><div>Thank you!</div><div>Raquel</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 30, 2016 at 11:08 PM, Akshay Maggu <span dir="ltr"><<a href="mailto:akshaymaggu86@gmail.com" target="_blank">akshaymaggu86@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Raquel, <div>It is usually recommended to clean up all your data, broadly, i.e. remove bad channels, remove large artifacts, HP filter, put to common average <b>before</b> you run ICA, for good results. You might wanna refer to Makoto's prep pipeline: <a href="https://sccn.ucsd.edu/wiki/Makoto's_preprocessing_pipeline" target="_blank">https://sccn.ucsd.ed<wbr>u/wiki/Makoto's_preprocessing_<wbr>pipeline</a></div><div><br></div><div>Bests,</div><div>Akshay</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><div><div>On Tue, Aug 30, 2016 at 11:38 PM, Raquel London <span dir="ltr"><<a href="mailto:raquellondon@gmail.com" target="_blank">raquellondon@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr">Dear eeglabbers,<div><br></div><div>I'm using an average reference for my experiment, and I want to try and use ICA to clean up some dirty electrodes to avoid having to throw them out.</div><div>Is it OK to do this first (run ICA, throw out any electrodes that could not be cleaned with ICA) and then afterwards do the rereferencing to the average? </div><div><br></div><div>Thank you!</div><span><font color="#888888"><div>Raquel</div></font></span></div>
<br></div></div><span>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a><br></span></blockquote></div><span><font color="#888888"><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr">Akshay Raj Maggu, <div><span style="font-size:12.8px">Laboratory for Language, Learning and the Brain,</span><br></div><div>Department of Linguistics and Modern Languages, </div><div>The Chinese University of Hong Kong, </div><div>Hong Kong.</div><div>Webpage: <a href="http://www.cuhk.edu.hk/lin/new/people/students/maggu/" target="_blank">http://www.cuhk.edu.h<wbr>k/lin/new/people/students/magg<wbr>u/</a></div><div><i>Save trees.. Save life! Please don't print this email unless you really need to.....</i></div></div></div></div></div></div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br></div></div>