<div dir="ltr">Dear Mohammed,<div><br></div><div><p class="MsoNormal">> What is the difference between these two mode?<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">This is from 'help std_spec()' which I entered as a blind guess :-) </p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">    'specmode'   - ['psd'|'fft'|'pburg'|'pmtm'] method to compute spectral </p><p class="MsoNormal">                   decomposition. 'psd' uses the spectopo function (optional</p><p class="MsoNormal">                   parameters to this function may be given as input). 'fft' </p><p class="MsoNormal">                   uses a simple fft on each trial. For continuous data</p><p class="MsoNormal">                   data trials are extracted automatically (see 'epochlim'</p><p class="MsoNormal">                   and 'epochrecur' below). Two experimental modes are </p><p class="MsoNormal">                   'pmtm' and 'pbug' which use multitaper and the Burg </p><p class="MsoNormal">                   method to compute spectrum respectively. NOTE THAT SOME</p><p class="MsoNormal">                   OF THESE OPTIONS REQUIRE THE SIGNAL PROCESSING TOOLBOX.</p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">> What is the method behind each of them?<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">Here is pwelch (i.e., 'psd')</p><p class="MsoNormal"><a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Welch%27s_method">https://en.wikipedia.org/wiki/Welch%27s_method</a><br></p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">I guess the difference is that pwelch uses a sliding window with 50% overlap and average, while fft uses a whole epoch to compute spectrum density. If I'm wrong, someone please correct me!</p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">> Is it possible to calculate logarithmic PSD using ‘psd’ mode?</p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">Is it not already log-converted?</p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">I know 'fft' results and 'psd' results look very different. Also, 'fft' method provides less degrees of freedom in optional parameter input than 'psd'.</p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal">Makoto</p><p class="MsoNormal"><br></p><p class="MsoNormal"><br></p></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 2, 2016 at 2:27 AM, Mohammed Jarjees <span dir="ltr"><<a href="mailto:m.jarjees.1@research.gla.ac.uk" target="_blank">m.jarjees.1@research.gla.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div lang="EN-GB"><div><p class="MsoNormal">Dear all,<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">I created study using EEGlab to compare the power spectrum density (PSD) between 4 groups for 2 conditions.<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">I need to compute PSD using “Spectopo” . However, there are two option of the “Specmode” (‘fft’ and ‘psd’). <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">I have try both of them and I got two different results.<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">My questions are :<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">                              <wbr>       What is the difference between these two mode?<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">                                     What is the method behind each of them?<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">                              <wbr>        Is it possible to calculate logarithmic PSD using ‘psd’ mode? <u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">Best Regrads<span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888"><u></u><u></u></font></span></p><span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888"><p class="MsoNormal">Mohammed<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p></font></span></div></div><br>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/<wbr>eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.<wbr>ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.<wbr>edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>