<div dir="ltr">Dear Raquel,<div><br></div><div>Just a follow up--</div><div><br></div><div class="gmail_extra">> how do such artifacts impact on time frequency analyses and/or ERP's?</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">This filter is to help ICA. If you apply time-frequency analysis down to 3 Hz, 1 Hz activity should not affect much (it's not zero, but probably negligible).</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">There are several papers saying 1-Hz high-pass 'distorts' ERP and no good. This is because a traditional averaged ERP waveform is a quite broad band toward low frequency. You said you know how to copy an ICA weight matrix calculated on filtered data and copy it to unfiltered data, so you should be compatible with the conventional ERP practice.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Sep 1, 2016 at 6:35 AM, Raquel London <span dir="ltr"><<a href="mailto:raquellondon@gmail.com" target="_blank">raquellondon@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>Thank you all for your answers and useful links. I have a follow-up question regarding the 1Hz filter Makoto suggests using before running ICA.<div>I would use this filter just for the ICA and then apply the weights to the unfiltered data. But I was actually wondering about the slow drifts that this filter tackles; how do such artifacts impact on time frequency analyses and/or ERP's? Can I leave them in (as I would if doing the backtransform), provided I am mainly interested in frequencies above 3 Hz? Or should I reject these trials regardless?</div></div><div><br></div><div>Thank you!</div><div>Raquel</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 30, 2016 at 11:08 PM, Akshay Maggu <span dir="ltr"><<a href="mailto:akshaymaggu86@gmail.com" target="_blank">akshaymaggu86@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Raquel, <div>It is usually recommended to clean up all your data, broadly, i.e. remove bad channels, remove large artifacts, HP filter, put to common average <b>before</b> you run ICA, for good results. You might wanna refer to Makoto's prep pipeline: <a href="https://sccn.ucsd.edu/wiki/Makoto's_preprocessing_pipeline" target="_blank">https://sccn.ucsd.ed<wbr>u/wiki/Makoto's_preprocessing_<wbr>pipeline</a></div><div><br></div><div>Bests,</div><div>Akshay</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><div><div class="gmail-h5"><div><div>On Tue, Aug 30, 2016 at 11:38 PM, Raquel London <span dir="ltr"><<a href="mailto:raquellondon@gmail.com" target="_blank">raquellondon@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div></div></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div><div class="gmail-h5"><div><div><div dir="ltr">Dear eeglabbers,<div><br></div><div>I'm using an average reference for my experiment, and I want to try and use ICA to clean up some dirty electrodes to avoid having to throw them out.</div><div>Is it OK to do this first (run ICA, throw out any electrodes that could not be cleaned with ICA) and then afterwards do the rereferencing to the average? </div><div><br></div><div>Thank you!</div><span><font color="#888888"><div>Raquel</div></font></span></div>
<br></div></div></div></div><span class="gmail-"><span>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a><br></span></span></blockquote></div><span><font color="#888888"><br><br clear="all"><span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr">Akshay Raj Maggu, <div><span style="font-size:12.8px">Laboratory for Language, Learning and the Brain,</span><br></div><div>Department of Linguistics and Modern Languages, </div><div>The Chinese University of Hong Kong, </div><div>Hong Kong.</div><div>Webpage: <a href="http://www.cuhk.edu.hk/lin/new/people/students/maggu/" target="_blank">http://www.cuhk.edu.h<wbr>k/lin/new/people/students/magg<wbr>u/</a></div><div><i>Save trees.. Save life! Please don't print this email unless you really need to.....</i></div></div></div></div></div></div>
</font></span></font></span></div>
</blockquote></div><br></div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/<wbr>eeglabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu">eeglablist-unsubscribe@sccn.<wbr>ucsd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu">eeglablist-request@sccn.ucsd.<wbr>edu</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>