<div dir="ltr">Dear Julie,<div><br></div><div>> Specifically, I have a 80 (freqs) x 200 (time points) x 1 (channel: three averaged into one) x 16 (subjects) array for each condition. <br><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">At least you want to apply Matlab function squeeze() to drop that singleton dimension.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">> Any advice on methods you know are supported by eeglab that allows you to plot ERSP changes with multiple channels averaged into a single plot would be greatly appreciated! </div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">I don't think there is dedicated EEGLAB function to visualize ERSP. It uses standard function such as imagesc() etc.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">> I see this commonly done in the literature but am uncertain of how it is executed. <br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Looks like you are familiar with coding. Why don't you plot it yourself? It's quite easy. It's like this. Assuming that you have your 80x200x16 data in 'data' and epoch time in EEG.times,</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">figure<br></div><div class="gmail_extra">imagesc(EEG.times, mean(data,3)); axis xy</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Makoto</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 27, 2016 at 8:39 PM, Schneider, Julie <span dir="ltr"><<a href="mailto:jxs114631@utdallas.edu" target="_blank">jxs114631@utdallas.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">



<div dir="auto">
<div>Hi Makoto,</div>
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature">Thank you so much for your timely response. Yes, I would like to average together these channels. I've successfully done this; however, that leaves my data in a 4-D array that I am struggling to plot. Specifically, I have a 80 (freqs)
 x 200 (time points) x 1 (channel: three averaged into one) x 16 (subjects) array for each condition. </div>
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature">Any advice on methods you know are supported by eeglab that allows you to plot ERSP changes with multiple channels averaged into a single plot would be greatly appreciated! I see this commonly done in the literature but am uncertain
 of how it is executed. </div>
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature">Thanks again for your assistance!</div><span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888">
<div id="gmail-m_1647505687068259910AppleMailSignature">Julie<br>
<br>
<div><br>
</div>
</div></font></span><div><div class="gmail-h5">
<div><br>
On Oct 27, 2016, at 9:33 PM, Makoto Miyakoshi <<a href="mailto:mmiyakoshi@ucsd.edu" target="_blank">mmiyakoshi@ucsd.edu</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div dir="ltr">Dear Julie,<br>
<br>
> I would like to investigate significant differences between my two conditions of interest when FC1,FC2, and C2 are merged together<br>
<br>
Merged? Do you mean averaged? If so, do you want to do it after computing ERSP, or do you want to concatenate the three time series?
<div><br>
</div>
<div>Anyway, I have never heard of concatenating channels in that way is supported by the current EEGLAB. You may be able to average ERSP of FC1, FC2, and C2, but you still need to write code to do it.</div>
<div><br>
</div>
<div>Makoto </div>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Thu, Oct 27, 2016 at 9:38 AM, Schneider, Julie <span dir="ltr">
<<a href="mailto:jxs114631@utdallas.edu" target="_blank">jxs114631@utdallas.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div id="gmail-m_1647505687068259910gmail-m_4289478551442284470divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif">
<p>Greetings,</p>
<p><br>
</p>
<p>Using the EEGlab toolbox, I have created a study and can plot the ERSP for an individual electrode, but cannot plot the average of multiple channels. Specifically, I would like to investigate significant differences between my two conditions of interest
 when FC1,FC2, and C2 are merged together. In attempting to solve this problem, I found a previous inquiry on the eeglab listserv:</p>
<p><a href="https://sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2011/004188.html" class="gmail-m_1647505687068259910gmail-m_4289478551442284470OWAAutoLink" id="gmail-m_1647505687068259910gmail-m_4289478551442284470LPlnk406114" target="_blank">https://sccn.ucsd.edu/pipermai<wbr>l/eeglablist/2011/004188.html</a>.</p>
<p><br>
</p>
<p>I have successfully been able to follow a portion of Arno's response ["<i>erspdata may then contain data of size (5 elecs x 12 subjects) for example when plotting scalp topographies.
</i><u style="font-style:italic">You may then average the first dimension</u>"]; however, I have not been able to successfully " <i>replot the result"</i>. The clear issue being that the new variable created by averaging this dimension [which is actually the
 third dimension in my data, and is executed using M=mean(my cell array, 3)] can not be plotted using std_erspplot because it is not a variable within the study. Other methods of plotting, such as image, imagesec, ft_plot_topo, and various attempts through
 the Fieldtrip toolbox, have proven unsuccessful.</p>
<p><br>
</p>
<p>Any additional information on how I may plot these merged channel files would be greatly appreciated. Further, the eeglablist question to which I am referencing was posted circa 2011, and I would imagine there may be newer methods/plug-ins that allow for
 this analysis to be conducted. Any recommendations that follow another methodology are welcomed and appreciated!</p>
<p><br>
</p>
<p>Best Regards,</p>
<p>Julie<br>
</p>
<p><br>
</p>
<div id="gmail-m_1647505687068259910gmail-m_4289478551442284470Signature">
<div id="gmail-m_1647505687068259910gmail-m_4289478551442284470divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">
<p>Julie M. Schneider, M.S.</p>
<p>Doctoral Student</p>
<p>The Developmental Neurolinguistics Lab</p>
<p>Brain and Behavioral Sciences, University of Texas at Dallas</p>
<p><br>
</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">
eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
<div class="gmail-m_1647505687068259910gmail_signature">
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>
Swartz Center for Computational Neuroscience<br>
Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div></div></div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div></div>