<div dir="ltr">Dear Enrico,<div><br></div><div>There are differences between spherical head model and MNI head model. The former is perfectly round (like a soccer ball) while the latter is more like a human head. The electrode montages optimized to these models have different coordinates.</div><div><br></div>> (electrodes defined by BESA trepass the head model border)<div><br></div><div>This means that the electrodes are below certain line of circumference. You can roughly estimate this line to be the one that connects Iz, Nz, and both Pre-Auricular locations. </div><div><br></div><div>Just FYI, there was a related discussion probably 3-4 years ago about what exactly the scalp topo outline means. I investigated it and found that at least for EEGLAB's scalp topos the definition of the line leaves ambiguity; it's not exactly 50% of something. I think I read Oostenveld & Praamstra 2001 or something, and also communicated with the first author of the paper (we know him of course!)</div><div><br></div><div>Makoto</div><div><br></div><div><br></div><div><br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Fri, Nov 18, 2016 at 8:57 AM, Fucci, Enrico <span dir="ltr"><<a href="mailto:e.fucci.12@alumni.ucl.ac.uk" target="_blank">e.fucci.12@alumni.ucl.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div id="m_7856739990541868320gmail-m_5036475166508425026divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif">
<p></p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">Dear all,</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">I hope you will help me elucidating this simple question:</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">After importing EEG data (64 electrodes cap) from Biosemi format into EEGlab (through Biosig), I procede to define channel coordinates. For this, I tried two different ways, that
 result in slightly different electrode configurations when plotted on a 2D template. </p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">The first method consists in adding a <b>.loc file </b>where electrode locations are derived from the template "GSN64v2_0.sfp" provided by EEGlab. Regarding the second method, I
 just automatically retrieve channel locations using the BESA file "standard-10-5-cap385.elp" implemented in dipfit, after having renamed channel labels from Biosemi to 10:20 convention. </p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">Both methods give locations coherent with the Biosemi layout, but slightly different in terms of matching with the 2D template (electrodes defined by BESA trepass the head model
 border). Does anyone know what is this difference caused by? </p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">You can find the .loc file and the two plots on the 2D template at the following link (do not mind the external electrodes) :</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><a href="https://www.dropbox.com/sh/56x8z3u8j80lyg9/AAC2lm95zy4eKxOr1kHSByMFa?dl=0" class="m_7856739990541868320gmail-m_5036475166508425026OWAAutoLink" id="m_7856739990541868320gmail-m_5036475166508425026LPlnk398618" target="_blank">https://www.dropbox.com/sh/56x<wbr>8z3u8j80lyg9/AAC2lm95zy4eKxOr1<wbr>kHSByMFa?dl=0</a><br>
</p>
<div><br>
</div>
<p></p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">Thank you very much for the support.</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">Best,</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><br>
</p>
<p style="font-family:calibri,arial,helvetica,sans-serif;font-size:16px">Enrico Fucci </p>
<br>
<p></p>
</div>
</div>

<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br>
To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br>
For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="m_7856739990541868320gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div></div>