<div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Dear Iman,</span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Sorry for belated response.</span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">> - 120ms baseline </span><br style="font-size:12.8px"><br style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">This seems too short. Unless your data are high-pass filtered at 1000/120 s = 8Hz, this is not recommended.</span><span class="gmail-im" style="font-size:12.8px"><br><br>> Thus, if I do the ANOVA test, I will have the multiple comparison problem since I will compare every single time point ( time window) in the baseline with the after-stim period.<br>Do you have any suggestions for me to deal with this issue?<br><div class="gmail_extra"><br></div></span><div class="gmail_extra" style="font-size:12.8px">See Groppe et al. (2010?) Mass univariate... paper. This explains FWER. I recommend you try GFWER with u==1, and also try larger numbers. I believe that if you can impose constrain of minimum continuum of 10 points for example, using u==10 can be justified (at least qualitatively speaking).</div><div class="gmail_extra" style="font-size:12.8px"><br></div><div class="gmail_extra" style="font-size:12.8px">Makoto</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Dec 16, 2016 at 5:58 PM, Iman Mohammad-Rezazadeh <span dir="ltr"><<a href="mailto:irezazadeh@ucdavis.edu" target="_blank">irezazadeh@ucdavis.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div id="m_3102208608453560393divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
Hi EEGLABers. </p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<br>
</p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
I wonder if anyone could point me to the correct way of doing the following analysis:<br>
</p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<br>
</p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
I have N trials of ERP recording with the following conditions:</p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
- 120ms baseline </p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
- 3000ms after stimulus onset.</p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt">- and all stim-locked ; </span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt"><br>
</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt"> I would like to figure out whether the stimulus modulates the neural activation by finding out the time frames which that significant modulations </span>happen.<span style="font-size:12pt"> </span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt"><br>
</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt">Thus, if I do the ANOVA test, I will have the multiple </span>comparison<span style="font-size:12pt"> </span>problem<span style="font-size:12pt"> <wbr>since I will compare every single time point ( time window) in the baseline
 with the after-</span>stim<span style="font-size:12pt"> period.</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt"><br>
</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt">Do you have any suggestions for me to deal with this issue?</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt"><br>
</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt">Best,</span></p>
<p style="font-size:16px;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<span style="font-size:12pt">Iman   </span></p>
<br>
<p></p>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div>