<div dir="ltr">Dear Gozde,<div><br></div><div>EEGLAB's ERSP by default plots dB converted values, namely (post stimulus power)/(baseline power). Therefore, in theory even if amplitude is attenuated, their ratio of before vs. after the stimulus onset should remain the same. However, I'm rather surprised that the ERSP plot seems intact up to 100Hz!</div><div><br></div><div>As you can see, if that 20Hz noise has constant power before and after the stimulus onset, they will cancel out after taking this ratio (which is why you don't notice 50/60Hz line noise in ERSP.)</div><div><br></div><div><span style="font-family:verdana,geneva,sans-serif;font-size:13.3333px">> In this case Notch filtering may not be necessary (as some people in my lab have recommended).</span></div><div><span style="font-family:verdana,geneva,sans-serif;font-size:13.3333px"><br></span></div><div><span style="font-family:verdana,geneva,sans-serif;font-size:13.3333px">Judging from the results, yes. Actually, the result rather seems to have demonstrated that frequency filter does not work on ERSP results. So applying notch filter would be meaningless. </span></div><div><span style="font-family:verdana,geneva,sans-serif;font-size:13.3333px"><br></span></div><div><span style="font-family:verdana,geneva,sans-serif;font-size:13.3333px">> Because in either case I will be analyzing the lower frequencies..Have I understood correctly?..</span><br></div><div><br></div><div>If you want to be rigorous, it could be still a good idea to limit your freq band of interest below the noise frequency. However, it's not a bad idea to include the broadband spectra if you don't see anything funny in the final result (this means that you proved the stationarity of the 20Hz noise, so they are invisible after baseline normalization by using dB.)</div><div><br></div><div>From Lufthansa455 to Frankfurt,</div><div><br></div><div>Makoto</div><div><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Dec 30, 2016 at 2:09 AM, Gozde BAYER <span dir="ltr"><<a href="mailto:gbayer@hacettepe.edu.tr" target="_blank">gbayer@hacettepe.edu.tr</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div style="font-size:10pt;font-family:verdana,geneva,sans-serif">
<p>Dear Makoto,</p>
<p>Thank you very much for your reply.</p>
<p>I have attached the ERSP analysis of channel C3 in jpg format. There are two conditions (hs,ss) from 7 subjects and the data were lowpass filtered at 20 Hz in the preprocessing step. As you may realize, there are still ersp data values just above 20 Hz (extending to about 30 Hz). I think it is due to the lowpass FIR filter that lowers the frequency amplitudes (above the filter value) slowly..But as you mentioned, the frequencies just below it (20 Hz) still seem intact. In this case Notch filtering may not be necessary (as some people in my lab have recommended). Because in either case I will be analyzing the lower frequencies..Have I understood correctly?..</p>
<p>Thank you very much again,<br>Best wishes.<br>Gözde BAYER</p><div><div class="gmail-h5">
<p> </p>
<p> </p>
<p>On 30-12-2016 02:17, Makoto Miyakoshi wrote:</p>
<blockquote type="cite" style="padding:0px 0.4em;border-left:2px solid rgb(16,16,255);margin:0px">
<div dir="ltr">Dear Gozde,
<div> </div>
<div>If you can upload screenshot of the data in question, I can help you better. Let's identify what was wrong.</div>
<div> </div>
<div>Generally speaking, it would be still ok to apply 20-Hz low pass filter if you say only < 20 Hz of your data seems intact, just in the worse case.</div>
<div> </div>
<div>Makoto</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Tue, Dec 13, 2016 at 11:21 PM, Gozde BAYER <span><<a href="mailto:gbayer@hacettepe.edu.tr" target="_blank">gbayer@hacettepe.edu.tr</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><br> Dear EEGLAB List,<br><br> During my raw EEG data recording from different subjects, I observed (online from the FFT plot of related software) some kind of 'noise' standing still at around 20-25 Hz and I could not get rid of that for some reason. So I decided to let EEG stream under<br> this condition. Therefore I applied low pass filtering to the raw data at 20 Hz, and analyzed offline the remaining frequencies with EEGLAB. I created STUDY design for the purpose of the experiment. But when I plot ERSP of a specific channel, I could still distinguish frequencies surviving above 25 Hz. I checked from the workspace of Matlab as well. What could be the reason of that? Since I am sometimes getting this 20 Hz peak during raw EEG data recoding (by the way, I am trying to find out why this is the case), it is important for me to really understand the phenomenon behind that..Indeed, those frequencies just above 20 Hz are also of great importance for my future analysis..If they are able to survive -somehow- then would it be reliable to analyze beta frequency band under this condition?<br><br> I appreciate any help,<br> Best wishes.<br><br> Gözde BAYER<br><br><br><br> ______________________________<wbr>_________________<br> Eeglablist page: <a href="http://sccn.ucsd.edu/eeglab/eeglabmail.html" target="_blank">http://sccn.ucsd.edu/eeglab/ee<wbr>glabmail.html</a><br> To unsubscribe, send an empty email to <a href="mailto:eeglablist-unsubscribe@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-unsubscribe@sccn.uc<wbr>sd.edu</a><br> For digest mode, send an email with the subject "set digest mime" to <a href="mailto:eeglablist-request@sccn.ucsd.edu" target="_blank">eeglablist-request@sccn.ucsd.e<wbr>du</a></blockquote>
</div>
<br><br clear="all">
<div> </div>
-- <br>
<div class="gmail-m_-8651243218320731532gmail_signature">
<div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<p> </p>
<div> </div>
</div></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Makoto Miyakoshi<br>Swartz Center for Computational Neuroscience<br>Institute for Neural Computation, University of California San Diego<br></div></div>
</div></div>